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Model info
Transcription factorAtf3
ModelATF3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndRRdRRWGASWMAn
Best auROC (human)0.876
Best auROC (mouse)0.934
Peak sets in benchmark (human)36
Peak sets in benchmark (mouse)16
Aligned words531
TF familyFos-related factors {1.1.2}
TF subfamilyATF-3-like factors {1.1.2.2}
MGIMGI:109384
EntrezGeneGeneID:11910
(SSTAR profile)
UniProt IDATF3_MOUSE
UniProt ACQ60765
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.57806
0.0005 12.38396
0.0001 16.09026
GTEx tissue expression atlas Atf3 expression
Motifs in JASPAR
MA0605.1 (Atf3; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0126.018.060.013.030.09.036.019.063.021.076.019.022.09.064.015.0
0236.018.085.02.031.015.09.02.073.018.0137.08.024.03.029.010.0
0368.027.064.05.037.012.05.00.0167.030.059.04.07.05.08.02.0
0498.028.0129.024.040.02.012.020.064.013.033.026.05.01.05.00.0
05112.03.090.02.031.00.010.03.080.06.084.09.08.02.055.05.0
06116.021.087.07.07.01.02.01.0115.051.070.03.011.01.06.01.0
0740.00.05.0204.049.01.01.023.050.03.01.0111.05.00.00.07.0
084.014.0126.00.00.00.04.00.00.01.06.00.02.06.0335.02.0
096.00.00.00.021.00.00.00.0443.05.022.01.02.00.00.00.0
1022.0165.0276.09.00.03.02.00.00.06.016.00.00.01.00.00.0
1113.02.01.06.034.01.06.0134.0141.08.062.083.06.00.00.03.0
1291.097.01.05.02.08.00.01.028.032.05.04.032.0191.03.00.0
13144.02.04.03.0313.06.05.04.02.00.06.01.03.04.03.00.0
1458.0122.0178.0104.09.00.03.00.02.07.05.04.01.00.01.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.181-0.5430.646-0.86-0.04-1.2150.14-0.490.695-0.3920.881-0.49-0.346-1.2150.711-0.721
020.14-0.5430.993-2.584-0.008-0.721-1.215-2.5840.841-0.5431.468-1.328-0.26-2.234-0.074-1.114
030.771-0.1440.711-1.770.167-0.938-1.77-4.41.666-0.040.63-1.975-1.454-1.77-1.328-2.584
041.135-0.1081.408-0.260.244-2.584-0.938-0.4390.711-0.860.054-0.181-1.77-3.126-1.77-4.4
051.268-2.2341.05-2.584-0.008-4.4-1.114-2.2340.932-1.60.981-1.215-1.328-2.5840.56-1.77
061.303-0.3921.016-1.454-1.454-3.126-2.584-3.1261.2940.4850.8-2.234-1.022-3.126-1.6-3.126
070.244-4.4-1.771.8660.445-3.126-3.126-0.3020.465-2.234-3.1261.259-1.77-4.4-4.4-1.454
08-1.975-0.7881.385-4.4-4.4-4.4-1.975-4.4-4.4-3.126-1.6-4.4-2.584-1.62.361-2.584
09-1.6-4.4-4.4-4.4-0.392-4.4-4.4-4.42.64-1.77-0.346-3.126-2.584-4.4-4.4-4.4
10-0.3461.6542.167-1.215-4.4-2.234-2.584-4.4-4.4-1.6-0.658-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4
11-0.86-2.584-3.126-1.60.083-3.126-1.61.4461.497-1.3280.6790.969-1.6-4.4-4.4-2.234
121.0611.124-3.126-1.77-2.584-1.328-4.4-3.126-0.1080.023-1.77-1.9750.0231.8-2.234-4.4
131.518-2.584-1.975-2.2342.293-1.6-1.77-1.975-2.584-4.4-1.6-3.126-2.234-1.975-2.234-4.4
140.6131.3531.731.194-1.215-4.4-2.234-4.4-2.584-1.454-1.77-1.975-3.126-4.4-3.126-1.6