Model info
Transcription factorCtcfl
ModelCTCFL_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbvvCCdSYAGGKGGCGChvbn
Best auROC (human)0.9776890284177797
Best auROC (mouse)0.9973487250852144
Peak sets in benchmark (human)25
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words500
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyCTCF-like factors{2.3.3.50}
MGI3652571
EntrezGene664799
UniProt IDCTCFL_MOUSE
UniProt ACA2APF3
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -2.19829
0.0005 0.41001
0.0001 5.94501
GTEx tissue expression atlas Ctcfl expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
018.07.022.02.038.060.072.047.038.038.044.010.07.025.064.09.0
0213.014.053.011.035.013.058.024.030.034.0116.022.09.022.029.08.0
036.071.08.02.08.058.07.010.09.0214.022.011.00.060.03.02.0
042.020.00.01.08.0390.02.03.01.037.01.01.00.023.02.00.0
052.02.05.02.0155.046.0198.071.00.03.01.01.00.02.03.00.0
067.082.066.02.012.016.020.05.020.0121.062.04.05.026.042.01.0
072.028.07.07.09.0140.017.079.07.0133.04.046.00.09.01.02.0
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092.00.0435.00.00.01.015.00.00.04.024.00.01.00.09.00.0
100.00.03.00.01.00.04.00.075.01.0405.02.00.00.00.00.0
112.00.070.04.00.01.00.00.021.028.0321.042.00.01.01.00.0
120.00.023.00.00.00.030.00.00.00.0392.00.00.00.046.00.0
130.00.00.00.00.00.00.00.02.06.0458.025.00.00.00.00.0
141.01.00.00.00.05.01.00.019.0437.01.01.00.025.00.00.0
152.00.018.00.068.01.0397.02.00.00.02.00.00.00.01.00.0
160.07.063.00.00.00.00.01.015.0378.013.012.00.02.00.00.0
171.09.01.04.037.0130.030.0190.010.036.09.021.01.06.03.03.0
183.016.028.02.072.059.037.013.05.032.05.01.016.039.0153.010.0
1912.031.040.013.013.031.048.054.014.096.027.086.04.09.09.04.0
2013.08.017.05.051.028.050.038.042.040.027.015.022.034.073.028.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.31-1.437-0.328-2.5660.2110.6640.8460.4220.2110.2110.357-1.096-1.437-0.2020.729-1.197
02-0.842-0.770.541-1.0040.13-0.8420.631-0.242-0.0220.1011.321-0.328-1.197-0.328-0.056-1.31
03-1.5820.832-1.31-2.566-1.310.631-1.437-1.096-1.1971.931-0.328-1.004-4.3850.664-2.216-2.566
04-2.566-0.421-4.385-3.109-1.312.531-2.566-2.216-3.1090.185-3.109-3.109-4.385-0.284-2.566-4.385
05-2.566-2.566-1.752-2.5661.610.4011.8540.832-4.385-2.216-3.109-3.109-4.385-2.566-2.216-4.385
06-1.4370.9750.759-2.566-0.92-0.64-0.421-1.752-0.4211.3630.697-1.958-1.752-0.1640.31-3.109
07-2.566-0.09-1.437-1.437-1.1971.508-0.5810.938-1.4371.457-1.9580.401-4.385-1.197-3.109-2.566
08-1.31-1.752-1.958-3.1092.238-1.752-1.437-1.437-0.842-1.582-1.197-3.1091.395-4.385-1.31-3.109
09-2.566-4.3852.64-4.385-4.385-3.109-0.703-4.385-4.385-1.958-0.242-4.385-3.109-4.385-1.197-4.385
10-4.385-4.385-2.216-4.385-3.109-4.385-1.958-4.3850.886-3.1092.568-2.566-4.385-4.385-4.385-4.385
11-2.566-4.3850.818-1.958-4.385-3.109-4.385-4.385-0.374-0.092.3360.31-4.385-3.109-3.109-4.385
12-4.385-4.385-0.284-4.385-4.385-4.385-0.022-4.385-4.385-4.3852.536-4.385-4.385-4.3850.401-4.385
13-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-2.566-1.5822.691-0.202-4.385-4.385-4.385-4.385
14-3.109-3.109-4.385-4.385-4.385-1.752-3.109-4.385-0.4722.644-3.109-3.109-4.385-0.202-4.385-4.385
15-2.566-4.385-0.525-4.3850.789-3.1092.549-2.566-4.385-4.385-2.566-4.385-4.385-4.385-3.109-4.385
16-4.385-1.4370.713-4.385-4.385-4.385-4.385-3.109-0.7032.5-0.842-0.92-4.385-2.566-4.385-4.385
17-3.109-1.197-3.109-1.9580.1851.434-0.0221.813-1.0960.158-1.197-0.374-3.109-1.582-2.216-2.216
18-2.216-0.64-0.09-2.5660.8460.6480.185-0.842-1.7520.041-1.752-3.109-0.640.2371.597-1.096
19-0.920.010.262-0.842-0.8420.010.4430.56-0.771.132-0.1261.022-1.958-1.197-1.197-1.958
20-0.842-1.31-0.581-1.7520.503-0.090.4830.2110.310.262-0.126-0.703-0.3280.1010.859-0.09