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Model info
Transcription factorCtcfl
ModelCTCFL_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbvvCCdSYAGGKGGCGChvbn
Best auROC (human)0.978
Best auROC (mouse)0.997
Peak sets in benchmark (human)25
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words500
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyCTCF-like factors {2.3.3.50}
MGIMGI:3652571
EntrezGeneGeneID:664799
(SSTAR profile)
UniProt IDCTCFL_MOUSE
UniProt ACA2APF3
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -2.1831400000000003
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0.0001 5.94456
GTEx tissue expression atlas Ctcfl expression
Motifs in JASPAR
MA1102.1 (CTCFL; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
018.07.022.02.038.060.072.047.038.038.044.010.07.025.064.09.0
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1912.031.040.013.013.031.048.054.014.096.027.086.04.09.09.04.0
2013.08.017.05.051.028.050.038.042.040.027.015.022.034.073.028.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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11-2.566-4.3850.818-1.958-4.385-3.109-4.385-4.385-0.374-0.092.3360.31-4.385-3.109-3.109-4.385
12-4.385-4.385-0.284-4.385-4.385-4.385-0.022-4.385-4.385-4.3852.536-4.385-4.385-4.3850.401-4.385
13-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-2.566-1.5822.691-0.202-4.385-4.385-4.385-4.385
14-3.109-3.109-4.385-4.385-4.385-1.752-3.109-4.385-0.4722.644-3.109-3.109-4.385-0.202-4.385-4.385
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