Model info
Transcription factorCtcf
ModelCTCF_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbbRCCRSYAGGKGGCGSbvbnb
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)1.0
Peak sets in benchmark (human)502
Peak sets in benchmark (mouse)263
Aligned words495
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyCTCF-like factors {2.3.3.50}
MGIMGI:109447
EntrezGeneGeneID:13018
(SSTAR profile)
UniProt IDCTCF_MOUSE
UniProt ACQ61164
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -1.62924
0.0005 1.04461
0.0001 6.776660000000001
GTEx tissue expression atlas Ctcf expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0110.029.014.045.05.046.019.061.021.062.017.072.03.046.013.032.0
023.05.026.05.039.041.065.038.012.016.022.013.017.028.0148.017.0
0313.05.048.05.031.05.047.07.044.030.0151.036.017.02.047.07.0
045.093.06.01.02.034.02.04.014.0252.015.012.00.054.00.01.0
050.020.00.01.04.0429.00.00.01.022.00.00.00.018.00.00.0
060.02.03.00.0317.09.0134.029.00.00.00.00.00.01.00.00.0
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081.06.01.02.045.0154.013.089.08.0143.06.021.00.01.02.03.0
0930.014.06.04.0299.00.02.03.017.02.01.02.097.01.013.04.0
101.00.0441.01.00.00.017.00.01.00.021.00.00.00.013.00.0
110.00.02.00.00.00.00.00.0171.00.0320.01.00.00.01.00.0
122.02.0126.041.00.00.00.00.014.014.0192.0103.00.00.01.00.0
130.00.015.01.00.00.016.00.02.01.0313.03.00.00.0144.00.0
140.01.01.00.00.00.00.01.012.010.0438.028.00.00.04.00.0
150.011.00.01.02.08.01.00.029.0398.00.016.00.029.00.00.0
162.00.028.01.0125.02.0318.01.00.01.00.00.00.01.016.00.0
173.025.098.01.00.02.01.01.027.0307.020.08.00.01.01.00.0
183.015.03.09.029.088.037.0181.09.073.012.026.01.06.03.00.0
194.019.015.04.0103.044.026.09.06.038.07.04.029.053.0130.04.0
2014.017.082.029.023.024.067.040.06.072.022.078.01.08.09.03.0
2110.012.018.04.038.020.029.034.074.049.032.025.022.028.062.038.0
2215.019.099.011.016.024.049.020.022.028.074.017.03.022.065.011.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.104-0.064-0.7780.371-1.760.393-0.480.673-0.3820.689-0.5890.838-2.2240.393-0.850.033
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03-0.85-1.760.435-1.760.002-1.760.414-1.4450.349-0.031.5750.15-0.589-2.5740.414-1.445
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05-4.392-0.429-4.392-3.117-1.9662.618-4.392-4.392-3.117-0.336-4.392-4.392-4.392-0.533-4.392-4.392
06-4.392-2.574-2.224-4.3922.316-1.2051.456-0.064-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-3.117-4.392-4.392
07-2.2241.8411.304-2.574-2.224-2.574-1.59-3.117-1.9661.0490.302-2.574-4.392-0.85-0.711-3.117
08-3.117-1.59-3.117-2.5740.3711.595-0.851.049-1.3181.521-1.59-0.382-4.392-3.117-2.574-2.224
09-0.03-0.778-1.59-1.9662.257-4.392-2.574-2.224-0.589-2.574-3.117-2.5741.134-3.117-0.85-1.966
10-3.117-4.3922.645-3.117-4.392-4.392-0.589-4.392-3.117-4.392-0.382-4.392-4.392-4.392-0.85-4.392
11-4.392-4.392-2.574-4.392-4.392-4.392-4.392-4.3921.7-4.3922.325-3.117-4.392-4.392-3.117-4.392
12-2.574-2.5741.3950.279-4.392-4.392-4.392-4.392-0.778-0.7781.8151.194-4.392-4.392-3.117-4.392
13-4.392-4.392-0.711-3.117-4.392-4.392-0.648-4.392-2.574-3.1172.303-2.224-4.392-4.3921.528-4.392
14-4.392-3.117-3.117-4.392-4.392-4.392-4.392-3.117-0.928-1.1042.639-0.098-4.392-4.392-1.966-4.392
15-4.392-1.012-4.392-3.117-2.574-1.318-3.117-4.392-0.0642.543-4.392-0.648-4.392-0.064-4.392-4.392
16-2.574-4.392-0.098-3.1171.387-2.5742.319-3.117-4.392-3.117-4.392-4.392-4.392-3.117-0.648-4.392
17-2.224-0.211.144-3.117-4.392-2.574-3.117-3.117-0.1342.284-0.429-1.318-4.392-3.117-3.117-4.392
18-2.224-0.711-2.224-1.205-0.0641.0370.1771.756-1.2050.851-0.928-0.172-3.117-1.59-2.224-4.392
19-1.966-0.48-0.711-1.9661.1940.349-0.172-1.205-1.590.203-1.445-1.966-0.0640.5331.426-1.966
20-0.778-0.5890.967-0.064-0.292-0.250.7660.254-1.590.838-0.3360.917-3.117-1.318-1.205-2.224
21-1.104-0.928-0.533-1.9660.203-0.429-0.0640.0930.8650.4550.033-0.21-0.336-0.0980.6890.203
22-0.711-0.481.155-1.012-0.648-0.250.455-0.429-0.336-0.0980.865-0.589-2.224-0.3360.736-1.012