Model info
Transcription factorCux2
ModelCUX2_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusddnhAATCAATvvh
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.876
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)5
Aligned words608
TF familyHD-CUT factors {3.1.9}
TF subfamilyCUX {3.1.9.2}
MGIMGI:107321
EntrezGeneGeneID:13048
(SSTAR profile)
UniProt IDCUX2_MOUSE
UniProt ACP70298
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.891110000000001
0.0005 11.845515
0.0001 16.208185
GTEx tissue expression atlas Cux2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01114.022.050.039.027.09.08.08.044.09.020.012.024.017.060.011.0
0239.022.043.0105.020.015.012.010.073.012.026.027.020.019.017.014.0
0392.020.013.027.033.013.05.017.044.020.016.018.044.084.010.018.0
04171.03.035.04.0120.05.012.00.017.00.025.02.059.02.018.01.0
05352.00.07.08.010.00.00.00.087.00.02.01.06.00.01.00.0
069.05.03.0438.00.00.00.00.00.00.00.010.01.00.00.08.0
072.08.00.00.02.02.00.01.00.03.00.00.05.0450.01.00.0
088.00.00.01.0416.05.035.07.01.00.00.00.01.00.00.00.0
09368.048.01.09.03.01.00.01.033.01.00.01.08.00.00.00.0
1010.06.05.0391.02.00.022.026.01.00.00.00.00.00.04.07.0
111.07.03.02.04.01.00.01.03.00.027.01.0196.0101.0101.026.0
12107.025.044.028.078.018.02.011.074.022.020.015.08.08.06.08.0
13149.037.042.039.029.017.05.022.023.018.014.017.012.010.015.025.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.338-0.2930.5180.272-0.092-1.162-1.275-1.2750.391-1.162-0.387-0.885-0.208-0.5460.699-0.969
020.272-0.2930.3691.256-0.387-0.668-0.885-1.0610.894-0.885-0.129-0.092-0.387-0.437-0.546-0.735
031.124-0.387-0.807-0.0920.107-0.807-1.718-0.5460.391-0.387-0.605-0.490.3911.034-1.061-0.49
041.742-2.1820.165-1.9231.389-1.718-0.885-4.356-0.546-4.356-0.167-2.5320.683-2.532-0.49-3.076
052.463-4.356-1.402-1.275-1.061-4.356-4.356-4.3561.069-4.356-2.532-3.076-1.548-4.356-3.076-4.356
06-1.162-1.718-2.1822.682-4.356-4.356-4.356-4.356-4.356-4.356-4.356-1.061-3.076-4.356-4.356-1.275
07-2.532-1.275-4.356-4.356-2.532-2.532-4.356-3.076-4.356-2.182-4.356-4.356-1.7182.709-3.076-4.356
08-1.275-4.356-4.356-3.0762.63-1.7180.165-1.402-3.076-4.356-4.356-4.356-3.076-4.356-4.356-4.356
092.5080.478-3.076-1.162-2.182-3.076-4.356-3.0760.107-3.076-4.356-3.076-1.275-4.356-4.356-4.356
10-1.061-1.548-1.7182.568-2.532-4.356-0.293-0.129-3.076-4.356-4.356-4.356-4.356-4.356-1.923-1.402
11-3.076-1.402-2.182-2.532-1.923-3.076-4.356-3.076-2.182-4.356-0.092-3.0761.8791.2171.217-0.129
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131.6050.220.3450.272-0.021-0.546-1.718-0.293-0.249-0.49-0.735-0.546-0.885-1.061-0.668-0.167