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Model info
Transcription factorDmrt1
ModelDMRT1_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnhdGhhACAAWGTWdChdn
Best auROC (human)0.567
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words541
TF familyDMRT {2.5.1}
TF subfamilyDMRT1 {2.5.1.0.1}
MGIMGI:1354733
EntrezGeneGeneID:50796
(SSTAR profile)
UniProt IDDMRT1_MOUSE
UniProt ACQ9QZ59
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.337860000000001
0.0005 9.65726
0.0001 14.58676
GTEx tissue expression atlas Dmrt1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0144.049.029.057.019.022.02.036.021.014.04.054.015.031.022.072.0
0241.06.027.025.052.07.04.053.022.03.014.018.045.09.083.082.0
0314.09.0133.04.03.01.017.04.08.06.0109.05.08.04.0164.02.0
0418.03.03.09.09.05.02.04.0170.0148.014.091.06.04.02.03.0
0562.025.023.093.074.014.02.070.09.05.01.06.028.07.06.066.0
06170.01.01.01.050.00.01.00.029.01.00.02.0230.01.01.03.0
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112.04.0144.01.00.00.03.00.01.01.06.00.03.01.0325.00.0
121.00.00.05.00.00.00.06.015.00.02.0461.00.00.00.01.0
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1483.01.094.082.02.01.02.015.015.01.017.012.038.07.076.045.0
153.0120.08.07.01.09.00.00.00.0181.04.04.02.0141.03.08.0
162.02.00.02.0213.0105.014.0119.07.04.02.02.07.06.02.04.0
17109.039.051.030.086.012.00.019.05.05.04.04.034.024.039.030.0
1878.042.057.057.024.019.03.034.018.021.019.036.010.020.014.039.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.3570.463-0.0560.613-0.472-0.328-2.5660.158-0.374-0.77-1.9580.56-0.7030.01-0.3280.846
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03-0.77-1.1971.457-1.958-2.216-3.109-0.581-1.958-1.31-1.5821.258-1.752-1.31-1.9581.666-2.566
04-0.525-2.216-2.216-1.197-1.197-1.752-2.566-1.9581.7021.563-0.771.079-1.582-1.958-2.566-2.216
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07-1.312.689-1.582-1.31-3.109-2.566-4.385-4.385-4.385-2.216-4.385-4.385-4.385-1.752-4.385-3.109
08-1.197-4.385-4.385-4.3852.586-1.958-4.3850.503-1.958-4.385-4.385-2.566-2.566-4.385-3.109-1.582
092.3881.057-4.385-4.385-2.216-3.109-4.385-4.385-3.109-4.385-4.385-4.3850.379-0.77-4.385-4.385
101.442-2.566-1.4372.075-0.421-3.109-3.1090.975-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385
11-2.566-1.9581.536-3.109-4.385-4.385-2.216-4.385-3.109-3.109-1.582-4.385-2.216-3.1092.349-4.385
12-3.109-4.385-4.385-1.752-4.385-4.385-4.385-1.582-0.703-4.385-2.5662.698-4.385-4.385-4.385-3.109
13-1.004-2.566-4.385-2.216-4.385-4.385-4.385-4.385-2.566-4.385-4.385-4.3852.075-0.5250.3791.66
140.987-3.1091.1110.975-2.566-3.109-2.566-0.703-0.703-3.109-0.581-0.920.211-1.4370.8990.379
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