Model info
Transcription factorDUX4
ModelDUX4_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusKWTGATTASATTCd
Best auROC (human)0.9714913994262521
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)5
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words367
TF familyPaired-related HD factors{3.1.3}
TF subfamilyDUX{3.1.3.7}
HGNC50800
EntrezGene100288687
UniProt IDDUX4_HUMAN
UniProt ACQ9UBX2
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -2.00279
0.0005 0.95722
0.0001 7.42587
GTEx tissue expression atlas DUX4 expression
ReMap ChIP-seq dataset list DUX4 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
017.02.06.05.015.01.00.012.0139.03.010.02.010.01.010.010.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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12-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7781.9652.145-3.778-3.778
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