Check the newest release v12
Model info
Transcription factorEgr1
ModelEGR1_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvbGYGKGGGYGGRRvbvbvv
Best auROC (human)0.991
Best auROC (mouse)0.986
Peak sets in benchmark (human)36
Peak sets in benchmark (mouse)12
Aligned words526
TF familyThree-zinc finger Krüppel-related factors {2.3.1}
TF subfamilyEGR factors {2.3.1.3}
MGIMGI:95295
EntrezGeneGeneID:13653
(SSTAR profile)
UniProt IDEGR1_MOUSE
UniProt ACP08046
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -0.05434
0.0005 2.5739599999999996
0.0001 8.245360000000002
GTEx tissue expression atlas Egr1 expression
Motifs in JASPAR
MA0162.1 (Egr1; Mus musculus)
MA0162.2 (EGR1; Homo sapiens)
MA0162.3 (EGR1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0122.017.050.08.026.020.041.014.060.035.085.014.05.019.059.015.0
0215.026.048.024.09.018.020.044.027.044.079.085.09.08.016.018.0
032.04.054.00.06.06.079.05.010.03.0148.02.07.06.0154.04.0
044.012.02.07.03.010.00.06.065.0294.03.073.02.06.00.03.0
051.00.073.00.01.00.0321.00.00.00.05.00.00.00.089.00.0
060.00.01.01.00.00.00.00.01.01.0270.0216.00.00.00.00.0
070.00.01.00.00.00.01.00.019.01.0251.00.00.00.0217.00.0
080.00.019.00.00.00.01.00.00.01.0466.03.00.00.00.00.0
090.00.00.00.00.00.01.00.00.00.0486.00.00.00.03.00.0
100.00.00.00.00.00.00.00.072.0302.00.0116.00.00.00.00.0
111.00.071.00.00.04.0297.01.00.00.00.00.01.00.0115.00.0
120.01.01.00.01.01.02.00.012.014.0377.080.00.00.01.00.0
132.02.09.00.01.04.07.04.0121.029.0201.030.03.08.060.09.0
1423.09.087.08.07.05.019.012.063.021.0165.028.010.04.026.03.0
1515.032.051.05.015.011.08.05.059.0106.094.038.06.014.026.05.0
1613.023.047.012.014.061.054.034.036.048.065.030.04.019.020.010.0
1713.010.037.07.032.037.047.035.041.042.070.033.011.011.046.018.0
1822.014.041.020.020.026.037.017.035.030.097.038.06.020.056.011.0
1915.013.049.06.015.026.030.019.060.033.0113.025.04.015.050.017.0
2025.010.050.09.021.017.029.020.048.053.0108.033.04.016.028.019.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.326-0.5790.485-1.308-0.162-0.4190.289-0.7680.6660.1321.013-0.768-1.75-0.470.65-0.701
02-0.701-0.1620.445-0.24-1.195-0.523-0.4190.359-0.1240.3590.941.013-1.195-1.308-0.638-0.523
03-2.564-1.9560.562-4.383-1.58-1.580.94-1.75-1.094-2.2141.565-2.564-1.435-1.581.605-1.956
04-1.956-0.918-2.564-1.435-2.214-1.094-4.383-1.580.7462.251-2.2140.861-2.564-1.58-4.383-2.214
05-3.107-4.3830.861-4.383-3.107-4.3832.338-4.383-4.383-4.383-1.75-4.383-4.383-4.3831.059-4.383
06-4.383-4.383-3.107-3.107-4.383-4.383-4.383-4.383-3.107-3.1072.1651.943-4.383-4.383-4.383-4.383
07-4.383-4.383-3.107-4.383-4.383-4.383-3.107-4.383-0.47-3.1072.093-4.383-4.383-4.3831.947-4.383
08-4.383-4.383-0.47-4.383-4.383-4.383-3.107-4.383-4.383-3.1072.711-2.214-4.383-4.383-4.383-4.383
09-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-3.107-4.383-4.383-4.3832.753-4.383-4.383-4.383-2.214-4.383
10-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.3830.8482.277-4.3831.323-4.383-4.383-4.383-4.383
11-3.107-4.3830.834-4.383-4.383-1.9562.261-3.107-4.383-4.383-4.383-4.383-3.107-4.3831.314-4.383
12-4.383-3.107-3.107-4.383-3.107-3.107-2.564-4.383-0.918-0.7682.4990.952-4.383-4.383-3.107-4.383
13-2.564-2.564-1.195-4.383-3.107-1.956-1.435-1.9561.365-0.0541.871-0.02-2.214-1.3080.666-1.195
14-0.282-1.1951.036-1.308-1.435-1.75-0.47-0.9180.715-0.3721.674-0.088-1.094-1.956-0.162-2.214
15-0.7010.0430.505-1.75-0.701-1.002-1.308-1.750.651.2331.1130.213-1.58-0.768-0.162-1.75
16-0.84-0.2820.424-0.918-0.7680.6830.5620.1030.160.4450.746-0.02-1.956-0.47-0.419-1.094
17-0.84-1.0940.187-1.4350.0430.1870.4240.1320.2890.3120.820.074-1.002-1.0020.403-0.523
18-0.326-0.7680.289-0.419-0.419-0.1620.187-0.5790.132-0.021.1440.213-1.58-0.4190.598-1.002
19-0.701-0.840.465-1.58-0.701-0.162-0.02-0.470.6660.0741.296-0.2-1.956-0.7010.485-0.579
20-0.2-1.0940.485-1.195-0.372-0.579-0.054-0.4190.4450.5431.2510.074-1.956-0.638-0.088-0.47