Model info
Transcription factorEgr1
ModelEGR1_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvbGYGKGGGYGGRRvbvbvv
Best auROC (human)0.9906386106100205
Best auROC (mouse)0.9862239433950486
Peak sets in benchmark (human)36
Peak sets in benchmark (mouse)12
Aligned words526
TF familyThree-zinc finger Kr├╝ppel-related factors{2.3.1}
TF subfamilyEGR factors{2.3.1.3}
MGI95295
EntrezGene13653
UniProt IDEGR1_MOUSE
UniProt ACP08046
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -0.06979
0.0005 2.58381
0.0001 8.24581
GTEx tissue expression atlas Egr1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0122.017.050.08.026.020.041.014.060.035.085.014.05.019.059.015.0
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1515.032.051.05.015.011.08.05.059.0106.094.038.06.014.026.05.0
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2025.010.050.09.021.017.029.020.048.053.0108.033.04.016.028.019.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.326-0.5790.485-1.308-0.162-0.4190.289-0.7680.6660.1321.013-0.768-1.75-0.470.65-0.701
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08-4.383-4.383-0.47-4.383-4.383-4.383-3.107-4.383-4.383-3.1072.711-2.214-4.383-4.383-4.383-4.383
09-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-3.107-4.383-4.383-4.3832.753-4.383-4.383-4.383-2.214-4.383
10-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.3830.8482.277-4.3831.323-4.383-4.383-4.383-4.383
11-3.107-4.3830.834-4.383-4.383-1.9562.261-3.107-4.383-4.383-4.383-4.383-3.107-4.3831.314-4.383
12-4.383-3.107-3.107-4.383-3.107-3.107-2.564-4.383-0.918-0.7682.4990.952-4.383-4.383-3.107-4.383
13-2.564-2.564-1.195-4.383-3.107-1.956-1.435-1.9561.365-0.0541.871-0.02-2.214-1.3080.666-1.195
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