Check the newest release v12
Model info
Transcription factorEsrrg
ModelERR3_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnbCAAGGWSAbn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.86
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words258
TF familySteroid hormone receptors (NR3) {2.1.1}
TF subfamilyER-like receptors (NR3A&B) {2.1.1.2}
MGIMGI:1347056
EntrezGeneGeneID:26381
(SSTAR profile)
UniProt IDERR3_MOUSE
UniProt ACP62509
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.492615
0.0005 11.239899999999999
0.0001 15.61506
GTEx tissue expression atlas Esrrg expression
Motifs in JASPAR
MA0643.1 (Esrrg; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
014.08.019.010.010.018.05.034.04.020.018.031.04.012.013.031.0
021.016.05.00.05.052.01.00.01.038.015.01.02.074.030.00.0
034.04.01.00.0178.01.00.01.048.00.02.01.01.00.00.00.0
04225.03.01.02.05.00.00.00.03.00.00.00.01.00.01.00.0
057.00.0225.02.01.00.01.01.00.00.02.00.00.00.02.00.0
060.02.05.01.00.00.00.00.02.03.0222.03.00.02.01.00.0
070.00.00.02.05.00.00.02.041.010.041.0136.03.00.00.01.0
082.034.012.01.00.07.02.01.01.038.00.02.00.0105.027.09.0
093.00.00.00.0160.07.014.03.034.02.04.01.012.01.00.00.0
1016.0110.053.030.00.07.01.02.02.012.03.01.00.01.00.03.0
1111.00.07.00.033.052.023.022.019.017.014.07.06.06.08.016.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.266-0.6130.228-0.398-0.3980.175-1.0590.802-1.2660.2780.1750.71-1.266-0.222-0.1440.71
02-2.440.059-1.059-3.805-1.0591.223-2.44-3.805-2.440.912-0.004-2.44-1.8831.5740.678-3.805
03-1.266-1.266-2.44-3.8052.449-2.44-3.805-2.441.144-3.805-1.883-2.44-2.44-3.805-3.805-3.805
042.683-1.528-2.44-1.883-1.059-3.805-3.805-3.805-1.528-3.805-3.805-3.805-2.44-3.805-2.44-3.805
05-0.741-3.8052.683-1.883-2.44-3.805-2.44-2.44-3.805-3.805-1.883-3.805-3.805-3.805-1.883-3.805
06-3.805-1.883-1.059-2.44-3.805-3.805-3.805-3.805-1.883-1.5282.67-1.528-3.805-1.883-2.44-3.805
07-3.805-3.805-3.805-1.883-1.059-3.805-3.805-1.8830.987-0.3980.9872.18-1.528-3.805-3.805-2.44
08-1.8830.802-0.222-2.44-3.805-0.741-1.883-2.44-2.440.912-3.805-1.883-3.8051.9230.574-0.5
09-1.528-3.805-3.805-3.8052.343-0.741-0.071-1.5280.802-1.883-1.266-2.44-0.222-2.44-3.805-3.805
100.0591.9691.2420.678-3.805-0.741-2.44-1.883-1.883-0.222-1.528-2.44-3.805-2.44-3.805-1.528
11-0.306-3.805-0.741-3.8050.7721.2230.4160.3720.2280.118-0.071-0.741-0.887-0.887-0.6130.059