Model info
Transcription factorEsr2
ModelESR2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length20
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbbnRGGYCRShvTGhCCYn
Best auROC (human)0.926
Best auROC (mouse)0.943
Peak sets in benchmark (human)11
Peak sets in benchmark (mouse)7
Aligned words223
TF familySteroid hormone receptors (NR3) {2.1.1}
TF subfamilyER-like receptors (NR3A&B) {2.1.1.2}
MGIMGI:109392
EntrezGeneGeneID:13983
(SSTAR profile)
UniProt IDESR2_MOUSE
UniProt ACO08537
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.97616
0.0005 8.089860000000002
0.0001 12.59191
GTEx tissue expression atlas Esr2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.022.016.09.09.025.00.012.05.033.032.012.07.019.011.011.0
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171.014.00.00.09.0176.01.07.00.04.00.00.01.09.01.00.0
181.06.00.04.016.068.05.0114.00.00.02.00.00.04.03.00.0
194.03.010.00.024.018.016.020.00.02.06.02.011.034.035.038.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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19-1.191-1.453-0.323-3.7430.5330.250.1350.354-3.743-1.809-0.812-1.809-0.230.8780.9060.988