Model info
Transcription factorFoxa2
ModelFOXA2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length16
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbnhTGTTTACWYWdn
Best auROC (human)0.9853927517032246
Best auROC (mouse)0.993988017342759
Peak sets in benchmark (human)22
Peak sets in benchmark (mouse)34
Aligned words501
TF familyForkhead box (FOX) factors{3.3.1}
TF subfamilyFOXA{3.3.1.1}
MGI1347476
EntrezGene15376
UniProt IDFOXA2_MOUSE
UniProt ACP35583
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.286760000000001
0.0005 10.81796
0.0001 16.05011
GTEx tissue expression atlas Foxa2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0115.027.023.016.019.059.04.038.015.063.018.030.013.095.031.032.0
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0340.022.021.011.051.031.08.0101.023.023.017.038.06.022.029.055.0
040.01.01.0118.00.00.00.098.01.00.00.074.00.00.01.0204.0
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080.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.020.00.00.0135.0341.0
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1471.020.0121.029.02.00.01.02.03.01.09.06.022.025.0137.049.0
1523.022.031.022.07.012.02.025.049.057.098.064.012.038.022.014.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.717-0.14-0.298-0.654-0.4860.634-1.9710.197-0.7170.699-0.539-0.036-0.8561.108-0.0040.027
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030.248-0.342-0.388-1.0180.489-0.004-1.3241.169-0.298-0.298-0.5950.197-1.596-0.342-0.070.564
04-4.397-3.122-3.1221.324-4.397-4.397-4.3971.139-3.122-4.397-4.3970.859-4.397-4.397-3.1221.87
05-3.122-4.397-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.58-4.3971.529-4.3972.406-4.397
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08-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.58-0.435-4.397-4.3971.4582.383
09-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.3971.465-4.397-3.122-4.3972.303-4.3970.365-3.122
10-1.7662.549-2.230.248-4.397-4.397-4.397-4.397-2.58-0.104-4.397-0.654-4.397-3.122-4.397-4.397
11-1.971-3.122-4.397-2.581.7770.248-3.1221.874-3.122-3.122-4.397-3.122-1.324-2.23-4.3970.365
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13-0.486-4.397-2.23-1.2111.139-3.122-4.3970.745-0.07-4.397-4.397-0.8561.108-1.971-0.6541.529
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15-0.298-0.342-0.004-0.342-1.451-0.934-2.58-0.2160.4490.5991.1390.715-0.9340.197-0.342-0.784