Model info
Transcription factorNr3c1
ModelGCR_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvvnvRGvACAvRvWGTnMhn
Best auROC (human)0.9832697892522585
Best auROC (mouse)0.9875182422732411
Peak sets in benchmark (human)143
Peak sets in benchmark (mouse)119
Aligned words747
TF familySteroid hormone receptors (NR3){2.1.1}
TF subfamilyGR-like receptors (NR3C){2.1.1.1}
MGI95824
EntrezGene
UniProt IDGCR_MOUSE
UniProt ACP06537
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.95321
0.0005 10.19221
0.0001 14.76311
GTEx tissue expression atlas Nr3c1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list Nr3c1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0119.06.089.09.023.020.08.017.022.09.035.07.023.08.033.07.0
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192.06.034.03.055.064.012.0129.01.01.03.01.01.014.02.07.0
2014.010.022.013.036.018.06.025.037.04.07.03.020.033.062.025.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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