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Model info
Transcription factorGRHL2
(GeneCards)
ModelGRHL2_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusRWCYKGTYYddChRS
Best auROC (human)0.98
Best auROC (mouse)0.966
Peak sets in benchmark (human)22
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words455
TF familyGrainyhead-related factors {6.7.1}
TF subfamilyGRH-like proteins {6.7.1.1}
HGNCHGNC:2799
EntrezGeneGeneID:79977
(SSTAR profile)
UniProt IDGRHL2_HUMAN
UniProt ACQ6ISB3
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.51571
0.0005 9.681510000000001
0.0001 14.041910000000001
GTEx tissue expression atlas GRHL2 expression
ReMap ChIP-seq dataset list GRHL2 datasets
Motifs in JASPAR
MA1105.1 (GRHL2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01235.01.019.024.011.02.00.05.075.00.016.015.022.02.04.023.0
020.0340.03.00.00.05.00.00.00.037.02.00.00.062.04.01.0
030.00.00.00.049.0281.014.0100.00.06.01.02.00.00.00.01.0
046.00.043.00.087.02.067.0131.06.00.08.01.02.01.085.015.0
050.00.0101.00.00.00.03.00.00.02.0200.01.00.00.0147.00.0
060.00.00.00.00.02.00.00.014.077.00.0360.00.00.01.00.0
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082.02.00.011.011.032.011.072.00.01.01.00.020.079.038.0174.0
090.02.029.02.017.022.013.062.05.02.037.06.038.029.099.091.0
1036.01.012.011.020.05.01.029.073.05.078.022.037.010.047.067.0
111.0162.02.01.00.021.00.00.00.0124.04.010.01.0125.03.00.0
120.00.00.02.0127.0188.06.0111.00.04.01.04.02.01.08.00.0
1355.01.070.03.0123.02.023.045.09.00.06.00.015.07.084.011.0
141.060.0138.03.03.02.01.04.02.039.0140.02.02.06.050.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.102-3.035-0.395-0.165-0.927-2.491-4.32-1.6760.964-4.32-0.563-0.626-0.251-2.491-1.881-0.207
02-4.322.471-2.14-4.32-4.32-1.676-4.32-4.32-4.320.262-2.491-4.32-4.320.774-1.881-3.035
03-4.32-4.32-4.32-4.320.5412.281-0.6931.25-4.32-1.505-3.035-2.491-4.32-4.32-4.32-3.035
04-1.505-4.320.411-4.321.111-2.4910.8511.519-1.505-4.32-1.233-3.035-2.491-3.0351.088-0.626
05-4.32-4.321.26-4.32-4.32-4.32-2.14-4.32-4.32-2.4911.941-3.035-4.32-4.321.634-4.32
06-4.32-4.32-4.32-4.32-4.32-2.491-4.32-4.32-0.6930.99-4.322.528-4.32-4.32-3.035-4.32
07-2.14-1.881-4.32-1.36-3.0350.235-4.320.388-4.32-4.32-3.035-4.32-0.9271.1-3.0352.211
08-2.491-2.491-4.32-0.927-0.9270.119-0.9270.923-4.32-3.035-3.035-4.32-0.3441.0150.2891.802
09-4.32-2.4910.022-2.491-0.503-0.251-0.7650.774-1.676-2.4910.262-1.5050.2890.0221.241.156
100.235-3.035-0.843-0.927-0.344-1.676-3.0350.0220.937-1.6761.003-0.2510.262-1.0190.4990.851
11-3.0351.731-2.491-3.035-4.32-0.296-4.32-4.32-4.321.464-1.881-1.019-3.0351.472-2.14-4.32
12-4.32-4.32-4.32-2.4911.4881.88-1.5051.354-4.32-1.881-3.035-1.881-2.491-3.035-1.233-4.32
130.655-3.0350.895-2.141.456-2.491-0.2070.456-1.12-4.32-1.505-4.32-0.626-1.361.076-0.927
14-3.0350.7421.571-2.14-2.14-2.491-3.035-1.881-2.4910.3141.585-2.491-2.491-1.5050.561-3.035