Check the newest release v12
Model info
Transcription factorHlf
ModelHLF_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnvTTRCAYAAbn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.973
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words514
TF familyC/EBP-related {1.1.8}
TF subfamilyPAR factors {1.1.8.2}
MGIMGI:96108
EntrezGeneGeneID:217082
(SSTAR profile)
UniProt IDHLF_MOUSE
UniProt ACQ8BW74
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.225185
0.0005 11.926590000000001
0.0001 15.15503
GTEx tissue expression atlas Hlf expression
Motifs in JASPAR
MA0043.1 (HLF; Homo sapiens)
MA0043.2 (HLF; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0120.028.060.03.034.031.09.02.022.030.053.011.022.058.086.011.0
025.04.01.088.01.05.00.0141.02.08.01.0197.01.04.00.022.0
030.01.04.04.01.02.00.018.00.01.00.01.01.04.025.0418.0
042.00.00.00.06.00.01.01.021.03.02.03.0248.027.0151.015.0
051.0185.00.091.01.026.00.03.01.0148.05.00.00.018.00.01.0
062.01.00.00.0319.029.015.014.01.03.00.01.078.05.00.012.0
0716.0183.018.0183.01.012.01.024.00.011.00.04.00.020.01.06.0
0811.05.01.00.0216.09.01.00.013.07.00.00.0148.053.06.010.0
09363.04.016.05.066.02.00.06.08.00.00.00.06.03.01.00.0
1024.0206.0105.0108.01.07.01.00.00.07.01.09.00.05.04.02.0
116.07.06.06.084.051.018.072.036.026.017.032.041.021.032.025.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.399-0.0680.687-2.1940.1240.032-1.175-2.544-0.3060.00.564-0.982-0.3060.6531.045-0.982
02-1.73-1.936-3.0881.068-3.088-1.73-4.3661.538-2.544-1.287-3.0881.871-3.088-1.936-4.366-0.306
03-4.366-3.088-1.936-1.936-3.088-2.544-4.366-0.502-4.366-3.088-4.366-3.088-3.088-1.936-0.182.622
04-2.544-4.366-4.366-4.366-1.56-4.366-3.088-3.088-0.351-2.194-2.544-2.1942.101-0.1041.606-0.681
05-3.0881.808-4.3661.101-3.088-0.141-4.366-2.194-3.0881.586-1.73-4.366-4.366-0.502-4.366-3.088
06-2.544-3.088-4.366-4.3662.352-0.033-0.681-0.748-3.088-2.194-4.366-3.0880.948-1.73-4.366-0.897
07-0.6181.798-0.5021.798-3.088-0.897-3.088-0.22-4.366-0.982-4.366-1.936-4.366-0.399-3.088-1.56
08-0.982-1.73-3.088-4.3661.963-1.175-3.088-4.366-0.82-1.414-4.366-4.3661.5860.564-1.56-1.074
092.481-1.936-0.618-1.730.782-2.544-4.366-1.56-1.287-4.366-4.366-4.366-1.56-2.194-3.088-4.366
10-0.221.9161.2441.272-3.088-1.414-3.088-4.366-4.366-1.414-3.088-1.175-4.366-1.73-1.936-2.544
11-1.56-1.414-1.56-1.561.0210.525-0.5020.8680.18-0.141-0.5580.0640.309-0.3510.064-0.18