Model info
Transcription factorIrf3
ModelIRF3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvdRRMdRGAAAvnGAAAvndvv
Best auROC (human)0.7974511183255293
Best auROC (mouse)0.9624570607911304
Peak sets in benchmark (human)6
Peak sets in benchmark (mouse)21
Aligned words510
TF familyInterferon-regulatory factors{3.5.3}
TF subfamilyIRF-3{3.5.3.0.3}
MGI1859179
EntrezGene54131
UniProt IDIRF3_MOUSE
UniProt ACP70671
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.28401
0.0005 11.49281
0.0001 16.10041
GTEx tissue expression atlas Irf3 expression
ReMap ChIP-seq dataset list Irf3 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0143.031.046.07.035.014.05.014.030.016.044.07.014.017.022.08.0
0247.07.051.017.056.01.014.07.047.05.054.011.016.01.011.08.0
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04139.02.050.08.04.01.00.03.098.06.020.09.04.01.07.01.0
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17276.08.018.016.08.00.00.06.09.03.00.02.02.01.01.03.0
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1915.09.08.017.053.042.02.052.032.022.036.035.07.04.08.011.0
2034.010.052.011.036.015.012.014.012.02.038.02.021.018.056.020.0
2153.08.033.09.025.010.03.07.090.021.037.010.012.07.019.09.0
2293.014.056.017.015.011.05.015.033.020.028.011.05.011.012.07.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.6590.3350.726-1.1130.455-0.445-1.43-0.4450.303-0.3150.682-1.113-0.445-0.256-0.003-0.986
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