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Model info
Transcription factorIrf3
ModelIRF3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvdRRMdRGAAAvnGAAAvndvv
Best auROC (human)0.797
Best auROC (mouse)0.962
Peak sets in benchmark (human)6
Peak sets in benchmark (mouse)21
Aligned words510
TF familyInterferon-regulatory factors {3.5.3}
TF subfamilyIRF-3 {3.5.3.0.3}
MGIMGI:1859179
EntrezGeneGeneID:54131
(SSTAR profile)
UniProt IDIRF3_MOUSE
UniProt ACP70671
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.29691
0.0005 11.48461
0.0001 16.10001
GTEx tissue expression atlas Irf3 expression
Motifs in JASPAR
MA1418.1 (IRF3; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0143.031.046.07.035.014.05.014.030.016.044.07.014.017.022.08.0
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2293.014.056.017.015.011.05.015.033.020.028.011.05.011.012.07.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.6590.3350.726-1.1130.455-0.445-1.43-0.4450.303-0.3150.682-1.113-0.445-0.256-0.003-0.986
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