Check the newest release v12
Model info
Transcription factorJunb
ModelJUNB_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length10
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvTGAGTCAbn
Best auROC (human)0.976
Best auROC (mouse)0.937
Peak sets in benchmark (human)8
Peak sets in benchmark (mouse)25
Aligned words518
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyJun factors {1.1.1.1}
MGIMGI:96647
EntrezGeneGeneID:16477
(SSTAR profile)
UniProt IDJUNB_MOUSE
UniProt ACP09450
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.357025
0.0005 10.523945
0.0001 15.759425
GTEx tissue expression atlas Junb expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
013.04.01.0211.04.02.00.0101.01.02.02.0132.03.03.00.031.0
021.03.05.02.00.01.09.01.01.00.00.02.02.04.0420.049.0
033.00.01.00.08.00.00.00.0429.01.00.04.054.00.00.00.0
0462.00.0432.00.01.00.00.00.00.00.01.00.00.00.04.00.0
051.00.00.062.00.00.00.00.09.02.02.0424.00.00.00.00.0
068.02.00.00.01.01.00.00.00.02.00.00.09.0474.03.00.0
0715.00.00.03.0472.01.04.02.02.00.00.01.00.00.00.00.0
0812.0202.097.0178.00.00.01.00.00.01.00.03.01.04.01.00.0
096.04.03.00.058.071.09.069.040.027.010.022.041.052.041.047.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.234-1.975-3.1261.899-1.975-2.584-4.41.165-3.126-2.584-2.5841.431-2.234-2.234-4.4-0.008
02-3.126-2.234-1.77-2.584-4.4-3.126-1.215-3.126-3.126-4.4-4.4-2.584-2.584-1.9752.5870.445
03-2.234-4.4-3.126-4.4-1.328-4.4-4.4-4.42.608-3.126-4.4-1.9750.542-4.4-4.4-4.4
040.679-4.42.615-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-1.975-4.4
05-3.126-4.4-4.40.679-4.4-4.4-4.4-4.4-1.215-2.584-2.5842.596-4.4-4.4-4.4-4.4
06-1.328-2.584-4.4-4.4-3.126-3.126-4.4-4.4-4.4-2.584-4.4-4.4-1.2152.708-2.234-4.4
07-0.721-4.4-4.4-2.2342.703-3.126-1.975-2.584-2.584-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4
08-0.9381.8561.1241.73-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-3.126-4.4-2.234-3.126-1.975-3.126-4.4
09-1.6-1.975-2.234-4.40.6130.814-1.2150.7850.244-0.144-1.114-0.3460.2690.5040.2690.404