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Model info
Transcription factorNfe2l2
ModelNF2L2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdnbWGCYRASTCAYbbb
Best auROC (human)0.901
Best auROC (mouse)0.99
Peak sets in benchmark (human)5
Peak sets in benchmark (mouse)26
Aligned words104
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyNF-E2-like factors {1.1.1.2}
MGIMGI:108420
EntrezGeneGeneID:18024
(SSTAR profile)
UniProt IDNF2L2_MOUSE
UniProt ACQ60795
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.85416
0.0005 9.00711
0.0001 13.617910000000002
GTEx tissue expression atlas Nfe2l2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0127.05.02.013.03.02.00.06.06.02.03.04.06.05.01.019.0
029.012.012.09.02.06.00.06.03.03.00.00.00.018.09.015.0
034.04.01.05.05.03.00.031.03.02.02.014.02.02.02.024.0
040.00.013.01.02.02.04.03.01.00.03.01.00.01.072.01.0
050.02.01.00.01.02.00.00.00.091.01.00.00.04.02.00.0
061.00.00.00.011.015.02.071.00.04.00.00.00.00.00.00.0
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100.00.00.08.00.00.00.016.00.00.00.079.00.00.00.01.0
110.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.0102.00.00.0
122.00.00.00.0101.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
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150.02.07.01.05.09.04.010.03.021.01.02.01.011.021.06.0
162.02.01.04.04.09.02.028.02.09.06.016.03.03.03.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.391-0.25-1.0870.672-0.725-1.087-3.152-0.076-0.076-1.087-0.725-0.459-0.076-0.25-1.6611.044
020.3130.5930.5930.313-1.087-0.076-3.152-0.076-0.725-0.725-3.152-3.152-3.1520.9910.3130.812
03-0.459-0.459-1.661-0.25-0.25-0.725-3.1521.528-0.725-1.087-1.0870.744-1.087-1.087-1.0871.275
04-3.152-3.1520.672-1.661-1.087-1.087-0.459-0.725-1.661-3.152-0.725-1.661-3.152-1.6612.365-1.661
05-3.152-1.087-1.661-3.152-1.661-1.087-3.152-3.152-3.1522.599-1.661-3.152-3.152-0.459-1.087-3.152
06-1.661-3.152-3.152-3.1520.5080.812-1.0872.351-3.152-0.459-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
07-3.152-0.4590.2-3.1520.313-0.459-0.725-0.725-3.152-1.661-1.661-3.152-0.25-1.6612.167-0.076
080.508-1.661-1.087-3.1520.2-3.152-3.152-1.0872.263-1.661-1.087-0.725-0.25-3.152-1.087-1.087
09-0.0760.7442.308-1.661-1.087-3.152-3.152-3.152-3.152-1.087-0.459-3.152-3.152-3.1520.071-3.152
10-3.152-3.152-3.1520.2-3.152-3.152-3.1520.875-3.152-3.152-3.1522.458-3.152-3.152-3.152-1.661
11-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-1.0872.712-3.152-3.152
12-1.087-3.152-3.152-3.1522.702-1.661-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
13-3.1521.619-0.4592.263-3.152-3.152-3.152-1.661-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
14-3.152-3.152-3.152-3.1520.20.313-3.1520.935-1.087-1.661-1.661-3.152-3.1520.9911.3541.189
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