Model info
Transcription factorNfe2l2
ModelNF2L2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdnbWGCYRASTCAYbbb
Best auROC (human)0.9009448134568028
Best auROC (mouse)0.990389006560151
Peak sets in benchmark (human)5
Peak sets in benchmark (mouse)26
Aligned words104
TF familyJun-related factors{1.1.1}
TF subfamilyNF-E2-like factors{1.1.1.2}
MGI108420
EntrezGene18024
UniProt IDNF2L2_MOUSE
UniProt ACQ60795
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.84161
0.0005 9.01531
0.0001 13.61781
GTEx tissue expression atlas Nfe2l2 expression
ReMap ChIP-seq dataset list Nfe2l2 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0127.05.02.013.03.02.00.06.06.02.03.04.06.05.01.019.0
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162.02.01.04.04.09.02.028.02.09.06.016.03.03.03.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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10-3.152-3.152-3.1520.2-3.152-3.152-3.1520.875-3.152-3.152-3.1522.458-3.152-3.152-3.152-1.661
11-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-1.0872.712-3.152-3.152
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13-3.1521.619-0.4592.263-3.152-3.152-3.152-1.661-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
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