Model info
Transcription factorNfil3
ModelNFIL3_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusdvTTATGYAAbn
Best auROC (human)0.576363256381793
Best auROC (mouse)0.878033895297111
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words504
TF familyC/EBP-related{1.1.8}
TF subfamilyPAR factors{1.1.8.2}
MGI109495
EntrezGene18030
UniProt IDNFIL3_MOUSE
UniProt ACO08750
Comment
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.63284
0.0005 11.64292
0.0001 15.62834
GTEx tissue expression atlas Nfil3 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0180.010.070.06.030.014.08.06.064.017.047.011.033.020.079.05.0
020.03.00.0204.01.00.00.060.00.02.02.0200.00.00.02.026.0
030.00.01.00.01.00.00.04.00.00.01.03.00.02.0127.0361.0
041.00.00.00.02.00.00.00.0107.04.03.015.0304.01.039.024.0
057.041.024.0342.00.00.01.04.04.00.04.034.02.00.03.034.0
060.00.013.00.00.00.041.00.00.01.031.00.011.08.0388.07.0
070.00.00.011.00.03.00.06.040.0156.04.0273.01.02.01.03.0
0841.00.00.00.0150.09.01.01.05.00.00.00.0252.038.02.01.0
09446.01.00.01.046.00.01.00.03.00.00.00.02.00.00.00.0
1017.0168.0100.0212.01.00.00.00.00.00.01.00.00.00.00.01.0
118.04.04.02.050.046.012.060.036.024.021.020.050.062.051.050.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.932-1.1140.8-1.6-0.04-0.788-1.328-1.60.711-0.5990.404-1.0220.054-0.4390.92-1.77
02-4.4-2.234-4.41.866-3.126-4.4-4.40.646-4.4-2.584-2.5841.846-4.4-4.4-2.584-0.181
03-4.4-4.4-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-1.975-4.4-4.4-3.126-2.234-4.4-2.5841.3932.436
04-3.126-4.4-4.4-4.4-2.584-4.4-4.4-4.41.222-1.975-2.234-0.7212.264-3.1260.219-0.26
05-1.4540.269-0.262.382-4.4-4.4-3.126-1.975-1.975-4.4-1.9750.083-2.584-4.4-2.2340.083
06-4.4-4.4-0.86-4.4-4.4-4.40.269-4.4-4.4-3.126-0.008-4.4-1.022-1.3282.508-1.454
07-4.4-4.4-4.4-1.022-4.4-2.234-4.4-1.60.2441.598-1.9752.157-3.126-2.584-3.126-2.234
080.269-4.4-4.4-4.41.559-1.215-3.126-3.126-1.77-4.4-4.4-4.42.0770.193-2.584-3.126
092.647-3.126-4.4-3.1260.383-4.4-3.126-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4-2.584-4.4-4.4-4.4
10-0.5991.6721.1551.904-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4-3.126
11-1.328-1.975-1.975-2.5840.4650.383-0.9380.6460.14-0.26-0.392-0.4390.4650.6790.4850.465