Retracted!
Do not use this motif!
Model info
Transcription factorNFKB1
ModelNFKB1_HUMAN.H11DI.0.A RETRACTED!!!
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnWGGGRAAbhSMSh
Best auROC (human)0.8673062498484677
Best auROC (mouse)0.9575882319722375
Peak sets in benchmark (human)7
Peak sets in benchmark (mouse)16
Aligned words319
TF familyNF-kappaB-related factors{6.1.1}
TF subfamilyNF-kappaB p50 subunit-like factors{6.1.1.1}
HGNC7794
EntrezGene4790
UniProt IDNFKB1_HUMAN
UniProt ACP19838
CommentRetracted motif!
Downloads pcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.08281
0.0005 11.82441
0.0001 15.31541
GTEx tissue expression atlas NFKB1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list NFKB1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0147.04.06.018.025.04.09.018.051.02.01.015.026.01.022.014.0
022.03.0139.05.00.00.011.00.00.01.036.01.01.01.061.02.0
030.00.03.00.01.00.03.01.046.01.0198.02.02.00.06.00.0
044.00.045.00.00.00.01.00.020.00.0188.02.00.00.02.01.0
0517.00.06.01.00.00.00.00.0171.03.057.05.03.00.00.00.0
06156.02.027.06.01.00.02.00.062.00.01.00.03.00.00.03.0
07201.04.09.08.02.00.00.00.027.01.02.00.08.00.01.00.0
0824.030.094.090.03.02.00.00.01.01.06.04.00.03.04.01.0
096.012.01.09.011.011.00.014.028.029.018.029.020.034.09.032.0
104.032.022.07.09.066.09.02.05.010.011.02.04.066.09.05.0
117.05.03.07.039.0130.03.02.032.014.01.04.07.04.02.03.0
124.031.041.09.05.0132.04.012.02.03.03.01.00.08.02.06.0
132.03.01.05.060.032.020.062.028.05.013.04.015.02.07.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.037-1.351-0.9720.0890.412-1.351-0.5850.0891.118-1.967-2.522-0.090.451-2.5220.286-0.157
02-1.967-1.6122.116-1.144-3.875-3.875-0.391-3.875-3.875-2.5220.773-2.522-2.522-2.5221.296-1.967
03-3.875-3.875-1.612-3.875-2.522-3.875-1.612-2.5221.016-2.5222.469-1.967-1.967-3.875-0.972-3.875
04-1.351-3.8750.994-3.875-3.875-3.875-2.522-3.8750.192-3.8752.418-1.967-3.875-3.875-1.967-2.522
050.033-3.875-0.972-2.522-3.875-3.875-3.875-3.8752.323-1.6121.229-1.144-1.612-3.875-3.875-3.875
062.232-1.9670.488-0.972-2.522-3.875-1.967-3.8751.312-3.875-2.522-3.875-1.612-3.875-3.875-1.612
072.485-1.351-0.585-0.698-1.967-3.875-3.875-3.8750.488-2.522-1.967-3.875-0.698-3.875-2.522-3.875
080.3720.5921.7261.683-1.612-1.967-3.875-3.875-2.522-2.522-0.972-1.351-3.875-1.612-1.351-2.522
09-0.972-0.307-2.522-0.585-0.391-0.391-3.875-0.1570.5240.5590.0890.5590.1920.716-0.5850.656
10-1.3510.6560.286-0.826-0.5851.374-0.585-1.967-1.144-0.484-0.391-1.967-1.3511.374-0.585-1.144
11-0.826-1.144-1.612-0.8260.8522.05-1.612-1.9670.656-0.157-2.522-1.351-0.826-1.351-1.967-1.612
12-1.3510.6250.901-0.585-1.1442.065-1.351-0.307-1.967-1.612-1.612-2.522-3.875-0.698-1.967-0.972
13-1.967-1.612-2.522-1.1441.280.6560.1921.3120.524-1.144-0.229-1.351-0.09-1.967-0.826-1.351