Model info
Transcription factorNfkb1
ModelNFKB1_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndGGGRAAbhCCCh
Best auROC (human)0.787
Best auROC (mouse)0.965
Peak sets in benchmark (human)7
Peak sets in benchmark (mouse)16
Aligned words528
TF familyNF-kappaB-related factors {6.1.1}
TF subfamilyNF-kappaB p50 subunit-like factors {6.1.1.1}
MGIMGI:97312
EntrezGeneGeneID:18033
(SSTAR profile)
UniProt IDNFKB1_MOUSE
UniProt ACP25799
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.68431
0.0005 9.866810000000001
0.0001 14.50561
GTEx tissue expression atlas Nfkb1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0173.07.031.052.064.013.012.043.046.08.017.026.037.012.042.017.0
027.01.0211.01.05.02.028.05.02.00.099.01.03.03.0129.03.0
031.00.016.00.03.00.03.00.026.02.0438.01.01.01.08.00.0
041.00.029.01.00.00.02.01.04.01.0455.05.00.00.01.00.0
054.00.01.00.01.00.00.00.0343.03.0130.011.06.00.01.00.0
06300.015.033.06.02.00.01.00.0119.06.07.00.01.01.00.09.0
07396.01.025.00.022.00.00.00.040.01.00.00.015.00.00.00.0
0864.069.0139.0201.00.00.02.00.00.01.00.024.00.00.00.00.0
0920.022.03.019.03.029.00.038.022.044.010.065.019.080.09.0117.0
107.046.010.01.015.0158.02.00.01.016.05.00.013.0221.04.01.0
110.034.01.01.024.0409.03.05.09.02.00.010.00.01.00.01.0
122.021.08.02.027.0404.06.09.01.00.03.00.01.05.03.08.0
1312.07.011.01.0143.091.043.0153.07.05.06.02.011.00.03.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.841-1.454-0.0080.5040.711-0.86-0.9380.3160.383-1.328-0.599-0.1810.167-0.9380.293-0.599
02-1.454-3.1261.899-3.126-1.77-2.584-0.108-1.77-2.584-4.41.145-3.126-2.234-2.2341.408-2.234
03-3.126-4.4-0.658-4.4-2.234-4.4-2.234-4.4-0.181-2.5842.629-3.126-3.126-3.126-1.328-4.4
04-3.126-4.4-0.074-3.126-4.4-4.4-2.584-3.126-1.975-3.1262.667-1.77-4.4-4.4-3.126-4.4
05-1.975-4.4-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-4.42.384-2.2341.416-1.022-1.6-4.4-3.126-4.4
062.251-0.7210.054-1.6-2.584-4.4-3.126-4.41.328-1.6-1.454-4.4-3.126-3.126-4.4-1.215
072.528-3.126-0.22-4.4-0.346-4.4-4.4-4.40.244-3.126-4.4-4.4-0.721-4.4-4.4-4.4
080.7110.7851.4831.851-4.4-4.4-2.584-4.4-4.4-3.126-4.4-0.26-4.4-4.4-4.4-4.4
09-0.439-0.346-2.234-0.49-2.234-0.074-4.40.193-0.3460.339-1.1140.726-0.490.932-1.2151.311
10-1.4540.383-1.114-3.126-0.7211.611-2.584-4.4-3.126-0.658-1.77-4.4-0.861.946-1.975-3.126
11-4.40.083-3.126-3.126-0.262.56-2.234-1.77-1.215-2.584-4.4-1.114-4.4-3.126-4.4-3.126
12-2.584-0.392-1.328-2.584-0.1442.548-1.6-1.215-3.126-4.4-2.234-4.4-3.126-1.77-2.234-1.328
13-0.938-1.454-1.022-3.1261.5111.0610.3161.579-1.454-1.77-1.6-2.584-1.022-4.4-2.234-1.77