Model info
Transcription factorNR4A1
ModelNR4A1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length10
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnAAAKGYCAn
Best auROC (human)0.9299699561769821
Best auROC (mouse)0.5161508046973925
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words507
TF familyNGFI-B-related receptors (NR4){2.1.4}
TF subfamilyNGFI-B (NR4A1){2.1.4.0.1}
HGNC7980
EntrezGene3164
UniProt IDNR4A1_HUMAN
UniProt ACP22736
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.934294999999999
0.0005 12.077415
0.0001 16.06807
GTEx tissue expression atlas NR4A1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list NR4A1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01129.01.05.04.0106.00.02.04.080.02.07.04.0131.01.010.09.0
02431.00.09.06.01.00.03.00.021.00.03.00.016.00.03.02.0
03463.02.03.01.00.00.00.00.018.00.00.00.07.00.01.00.0
046.03.0322.0157.00.00.01.01.01.02.01.00.00.00.01.00.0
050.01.05.01.00.01.04.00.05.02.0313.05.02.01.0154.01.0
061.01.02.03.00.02.01.02.010.055.045.0366.00.01.00.06.0
072.06.03.00.00.056.00.03.02.042.02.02.00.0343.02.032.0
082.00.02.00.0422.01.010.014.05.01.00.01.024.03.09.01.0
09126.0129.0113.085.00.03.01.01.07.05.03.06.00.02.011.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.418-3.117-1.76-1.9661.223-4.392-2.574-1.9660.942-2.574-1.445-1.9661.434-3.117-1.104-1.205
022.623-4.392-1.205-1.59-3.117-4.392-2.224-4.392-0.382-4.392-2.224-4.392-0.648-4.392-2.224-2.574
032.694-2.574-2.224-3.117-4.392-4.392-4.392-4.392-0.533-4.392-4.392-4.392-1.445-4.392-3.117-4.392
04-1.59-2.2242.3311.614-4.392-4.392-3.117-3.117-3.117-2.574-3.117-4.392-4.392-4.392-3.117-4.392
05-4.392-3.117-1.76-3.117-4.392-3.117-1.966-4.392-1.76-2.5742.303-1.76-2.574-3.1171.595-3.117
06-3.117-3.117-2.574-2.224-4.392-2.574-3.117-2.574-1.1040.570.3712.459-4.392-3.117-4.392-1.59
07-2.574-1.59-2.224-4.392-4.3920.588-4.392-2.224-2.5740.302-2.574-2.574-4.3922.394-2.5740.033
08-2.574-4.392-2.574-4.3922.601-3.117-1.104-0.778-1.76-3.117-4.392-3.117-0.25-2.224-1.205-3.117
091.3951.4181.2861.003-4.392-2.224-3.117-3.117-1.445-1.76-2.224-1.59-4.392-2.574-1.012-2.224