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Model info
Transcription factorNr4a1
ModelNR4A1_MOUSE.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length10
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnAAAKGYCAn
Best auROC (human)0.929
Best auROC (mouse)0.586
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words511
TF familyNGFI-B-related receptors (NR4) {2.1.4}
TF subfamilyNGFI-B (Nur77, NR4A1) {2.1.4.0.1}
MGIMGI:1352454
EntrezGeneGeneID:15370
(SSTAR profile)
UniProt IDNR4A1_MOUSE
UniProt ACP12813
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.418235
0.0005 11.870305
0.0001 16.342489999999998
GTEx tissue expression atlas Nr4a1 expression
Motifs in JASPAR
MA1112.1 (NR4A1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01109.01.015.012.091.01.01.08.0111.02.01.03.0123.02.013.07.0
02422.01.09.02.04.00.02.00.027.01.02.00.026.00.03.01.0
03474.03.02.00.02.00.00.00.016.00.00.00.03.00.00.00.0
049.03.0295.0188.00.00.00.03.01.00.01.00.00.00.00.00.0
051.00.09.00.00.01.02.00.02.03.0287.04.012.01.0177.01.0
061.02.08.04.01.01.00.03.011.076.056.0332.00.00.02.03.0
070.011.02.00.05.069.02.03.01.058.06.01.04.0319.02.017.0
088.02.00.00.0428.08.015.06.010.01.00.01.020.01.00.00.0
09137.0111.0113.0105.02.05.04.01.03.06.01.05.01.02.02.02.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.241-3.126-0.721-0.9381.061-3.126-3.126-1.3281.259-2.584-3.126-2.2341.361-2.584-0.86-1.454
022.592-3.126-1.215-2.584-1.975-4.4-2.584-4.4-0.144-3.126-2.584-4.4-0.181-4.4-2.234-3.126
032.708-2.234-2.584-4.4-2.584-4.4-4.4-4.4-0.658-4.4-4.4-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4
04-1.215-2.2342.2341.784-4.4-4.4-4.4-2.234-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4
05-3.126-4.4-1.215-4.4-4.4-3.126-2.584-4.4-2.584-2.2342.206-1.975-0.938-3.1261.724-3.126
06-3.126-2.584-1.328-1.975-3.126-3.126-4.4-2.234-1.0220.8810.5782.352-4.4-4.4-2.584-2.234
07-4.4-1.022-2.584-4.4-1.770.785-2.584-2.234-3.1260.613-1.6-3.126-1.9752.312-2.584-0.599
08-1.328-2.584-4.4-4.42.606-1.328-0.721-1.6-1.114-3.126-4.4-3.126-0.439-3.126-4.4-4.4
091.4681.2591.2761.203-2.584-1.77-1.975-3.126-2.234-1.6-3.126-1.77-3.126-2.584-2.584-2.584