Model info
Transcription factorNRF1
ModelNRF1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbdSYGCGCAKGCGCvnbn
Best auROC (human)0.9994367108202549
Best auROC (mouse)0.9989127632075153
Peak sets in benchmark (human)31
Peak sets in benchmark (mouse)23
Aligned words512
TF familyNRF{0.0.6}
TF subfamilyNRF-1 (alpha-pal){0.0.6.0.1}
HGNC7996
EntrezGene4899
UniProt IDNRF1_HUMAN
UniProt ACQ16656
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -1.9155900000000001
0.0005 0.43336
0.0001 5.50416
GTEx tissue expression atlas NRF1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list NRF1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0112.039.021.08.020.078.025.040.024.071.017.026.05.079.020.014.0
0214.05.026.016.0149.016.011.091.035.09.013.026.021.011.035.021.0
0320.0109.080.010.02.028.011.00.06.045.025.09.05.080.054.015.0
041.05.05.022.08.09.014.0231.013.018.014.0125.02.06.03.023.0
051.00.023.00.05.00.033.00.04.01.031.00.026.00.0375.00.0
061.035.00.00.00.01.00.00.015.0441.05.01.00.00.00.00.0
070.00.016.00.01.01.0475.00.00.00.05.00.00.00.01.00.0
080.01.00.00.00.01.00.00.00.0494.02.01.00.00.00.00.0
090.00.00.00.0398.054.033.011.01.01.00.00.00.01.00.00.0
1019.032.090.0258.01.01.00.054.01.00.00.032.00.01.00.010.0
110.01.020.00.01.00.033.00.07.015.068.00.00.01.0353.00.0
120.08.00.00.00.012.01.04.06.0433.01.034.00.00.00.00.0
131.00.05.00.02.07.0385.059.00.01.01.00.00.06.028.04.0
140.03.00.00.03.08.00.03.00.0339.04.076.00.055.01.07.0
150.01.02.00.0188.066.0111.040.01.02.01.01.020.014.045.07.0
1650.037.089.033.022.021.019.021.040.022.067.030.015.06.019.08.0
176.037.073.011.05.030.031.020.024.074.079.017.07.023.047.015.0
189.07.025.01.023.059.031.051.056.081.060.033.012.011.027.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.9360.221-0.39-1.326-0.4370.909-0.2180.246-0.2580.816-0.597-0.179-1.7680.922-0.437-0.786
02-0.786-1.768-0.179-0.6561.554-0.656-1.021.0630.114-1.213-0.858-0.179-0.39-1.020.114-0.39
03-0.4371.2430.934-1.112-2.582-0.106-1.02-4.398-1.5980.363-0.218-1.213-1.7680.9340.544-0.719
04-3.124-1.768-1.768-0.344-1.326-1.213-0.7861.992-0.858-0.541-0.7861.379-2.582-1.598-2.232-0.3
05-3.124-4.398-0.3-4.398-1.768-4.3980.056-4.398-1.973-3.124-0.006-4.398-0.179-4.3982.476-4.398
06-3.1240.114-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-0.7192.638-1.768-3.124-4.398-4.398-4.398-4.398
07-4.398-4.398-0.656-4.398-3.124-3.1242.712-4.398-4.398-4.398-1.768-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398
08-4.398-3.124-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-4.3982.751-2.582-3.124-4.398-4.398-4.398-4.398
09-4.398-4.398-4.398-4.3982.5350.5440.056-1.02-3.124-3.124-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398
10-0.4880.0251.0522.102-3.124-3.124-4.3980.544-3.124-4.398-4.3980.025-4.398-3.124-4.398-1.112
11-4.398-3.124-0.437-4.398-3.124-4.3980.056-4.398-1.452-0.7190.773-4.398-4.398-3.1242.415-4.398
12-4.398-1.326-4.398-4.398-4.398-0.936-3.124-1.973-1.5982.619-3.1240.085-4.398-4.398-4.398-4.398
13-3.124-4.398-1.768-4.398-2.582-1.4522.5020.632-4.398-3.124-3.124-4.398-4.398-1.598-0.106-1.973
14-4.398-2.232-4.398-4.398-2.232-1.326-4.398-2.232-4.3982.375-1.9730.883-4.3980.562-3.124-1.452
15-4.398-3.124-2.582-4.3981.7860.7431.2610.246-3.124-2.582-3.124-3.124-0.437-0.7860.363-1.452
160.4670.1691.0410.056-0.344-0.39-0.488-0.390.246-0.3440.758-0.038-0.719-1.598-0.488-1.326
17-1.5980.1690.843-1.02-1.768-0.038-0.006-0.437-0.2580.8570.922-0.597-1.452-0.30.406-0.719
18-1.213-1.452-0.218-3.124-0.30.632-0.0060.4870.580.9470.6480.056-0.936-1.02-0.142-0.858