Model info
Transcription factorOvol2
ModelOVOL2_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length11
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusndndTAACGGd
Best auROC (human)0.45423639154325646
Best auROC (mouse)0.963245610101602
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words185
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyOVOL-factors{2.3.3.17}
MGI1338039
EntrezGene107586
UniProt IDOVOL2_MOUSE
UniProt ACQ8CIV7
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.482965
0.0005 4.67459
0.0001 7.03501
GTEx tissue expression atlas Ovol2 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0127.04.05.07.023.05.014.04.030.05.013.05.014.04.014.011.0
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0331.04.018.03.018.013.06.017.015.06.08.08.016.07.011.04.0
040.00.00.080.00.00.00.030.00.00.00.043.00.00.00.032.0
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090.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0185.00.00.00.00.00.0
100.00.00.00.00.00.00.00.067.010.039.069.00.00.00.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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030.969-1.0110.433-1.2740.4330.114-0.6310.3770.254-0.631-0.356-0.3560.317-0.484-0.048-1.011
04-3.596-3.596-3.5961.911-3.596-3.596-3.5960.936-3.596-3.596-3.5961.293-3.596-3.596-3.5961.0
05-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.5962.747-3.596-3.596-3.596
062.719-3.596-0.803-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596
07-3.5962.719-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-0.803-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596
08-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.5962.747-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596
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10-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.596-3.5961.734-0.1411.1961.763-3.596-3.596-3.596-3.596