Model info
Transcription factorZNF146
ModelOZF_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYCYTTTTYATGGCTGMATARTATTCCA
Best auROC (human)0.991619351337063
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words453
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF146-like factors{2.3.3.55}
HGNC12931
EntrezGene7705
UniProt IDOZF_HUMAN
UniProt ACQ15072
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -21.69804
0.0005 -17.89474
0.0001 -9.558589999999999
GTEx tissue expression atlas ZNF146 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF146 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.01.00.01.018.0103.01.03.03.08.00.00.08.0297.03.04.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-4.313-4.313-4.313-1.351-4.313-4.313-4.3131.872-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.3132.204
04-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.351-1.012.721
05-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.351-4.313-4.313-4.313-1.01-4.313-3.027-3.0272.717
06-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-3.027-4.313-4.313-4.313-3.027-2.132-4.313-2.4822.744
07-4.313-2.132-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-3.027-4.313-3.027-0.6842.328-0.1981.407
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12-4.313-1.224-4.313-3.027-4.313-3.027-4.313-4.313-4.3132.684-1.351-0.554-4.313-4.313-4.313-4.313
13-4.313-4.313-4.313-4.313-1.497-0.617-4.3132.655-4.313-4.313-4.313-1.351-3.027-3.027-4.313-0.617
14-4.313-4.313-1.351-4.313-2.482-4.313-0.756-3.027-4.313-4.313-4.313-4.313-0.918-1.8732.669-3.027
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161.097-1.2240.815-4.3131.888-4.313-0.386-4.313-4.313-4.313-3.027-4.3130.682-3.027-0.004-4.313
17-4.313-4.313-4.3132.447-4.313-4.313-4.313-1.111-4.313-4.313-4.3131.372-4.313-4.313-4.313-4.313
18-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.3132.737-2.132-1.873-2.132
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20-4.313-4.313-4.3131.622-4.313-3.027-4.313-0.077-4.313-2.482-4.3132.261-4.313-4.313-4.313-1.873
21-4.313-4.313-4.313-4.313-2.132-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.3132.728-4.313-1.111-2.482
22-4.3130.42-2.1322.625-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.111-4.313-4.313-4.313-2.482
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