Model info
Transcription factorTP53
ModelP53_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnndRRCAKGbMSMRACAWGbMbn
Best auROC (human)0.9974851675578215
Best auROC (mouse)0.9876645557906097
Peak sets in benchmark (human)141
Peak sets in benchmark (mouse)39
Aligned words598
TF familyp53-related factors{6.3.1}
TF subfamilyp53{6.3.1.0.1}
HGNC11998
EntrezGene7157
UniProt IDP53_HUMAN
UniProt ACP04637
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.45641
0.0005 5.8461099999999995
0.0001 10.95046
GTEx tissue expression atlas TP53 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TP53 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0117.068.065.015.018.041.02.032.022.036.047.040.014.021.039.012.0
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0324.09.0175.017.015.01.02.08.030.03.0110.010.08.01.061.015.0
0464.01.09.03.012.00.02.00.0193.04.0139.012.029.01.011.09.0
050.0246.047.05.00.05.00.01.00.0160.00.01.00.020.02.02.0
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080.00.050.01.06.00.07.00.063.00.016.00.01.00.0344.01.0
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127.01.06.01.0252.059.032.039.058.01.01.03.026.01.00.02.0
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1485.01.016.02.023.00.00.00.0236.00.0107.01.08.00.05.05.0
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1810.02.056.012.016.03.013.00.056.00.03.01.04.03.0309.01.0
193.015.060.08.02.05.01.00.020.0207.011.0143.00.00.010.04.0
207.012.01.05.043.0165.02.017.058.019.01.04.017.082.07.049.0
215.043.066.011.025.0154.06.093.00.011.00.00.02.044.011.018.0
226.013.09.04.0110.057.030.055.054.013.012.04.017.020.051.034.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.5770.7930.748-0.699-0.5210.291-2.5620.045-0.3240.1620.4260.266-0.766-0.370.241-0.916
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03-0.238-1.1931.735-0.577-0.699-3.105-2.562-1.306-0.018-2.2121.272-1.092-1.306-3.1050.685-0.699
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06-4.382-4.382-4.382-4.3822.424-0.636-0.7660.5260.426-3.105-4.382-3.105-3.105-1.954-2.212-3.105
070.189-1.00.892.182-3.105-3.105-4.382-0.468-2.562-4.382-2.212-0.916-1.0-3.105-3.1050.291
08-4.382-4.3820.487-3.105-1.578-4.382-1.433-4.3820.717-4.382-0.636-4.382-3.105-4.3822.409-3.105
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10-1.578-1.193-1.748-2.562-0.1221.763-1.748-0.4170.635-2.562-4.382-4.382-0.4681.126-0.280.215
11-2.5620.60.467-2.212-1.1932.118-2.212-0.577-2.212-0.122-2.562-3.105-3.1050.314-1.193-1.306
12-1.433-3.105-1.578-3.1052.0990.6520.0450.2410.635-3.105-3.105-2.212-0.159-3.105-4.382-2.562
130.383-0.5772.179-1.3060.507-1.954-2.212-1.954-1.954-4.3820.076-2.562-1.954-2.5620.134-1.954
141.015-3.105-0.636-2.562-0.28-4.382-4.382-4.3822.033-4.3821.244-3.105-1.306-4.382-1.748-1.748
15-2.5622.383-0.838-2.562-4.382-3.105-4.382-4.382-1.7481.375-3.105-4.382-4.382-1.433-3.105-4.382
16-4.382-1.433-4.382-4.3822.548-0.916-1.3060.487-0.838-3.105-4.382-3.105-3.105-4.382-3.105-4.382
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