Model info
Transcription factorTp53
ModelP53_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvnRRACAWGYMYdGRCWdGhYhn
Best auROC (human)0.998539807007965
Best auROC (mouse)0.993668412010367
Peak sets in benchmark (human)141
Peak sets in benchmark (mouse)39
Aligned words514
TF familyp53-related factors{6.3.1}
TF subfamilyp53{6.3.1.0.1}
MGI98834
EntrezGene22059
UniProt IDP53_MOUSE
UniProt ACP02340
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.88731
0.0005 6.24421
0.0001 11.30986
GTEx tissue expression atlas Tp53 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0132.040.033.012.0125.030.011.047.019.018.022.032.020.018.022.012.0
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2215.019.036.09.0137.042.049.038.07.013.09.014.021.038.035.011.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.0370.2580.068-0.9241.391-0.026-1.0080.418-0.476-0.529-0.3320.037-0.425-0.529-0.332-0.924
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