Model info
Transcription factorPOU5F1
ModelPO5F1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbYWTTSWhATGYARRhn
Best auROC (human)0.9862450296490604
Best auROC (mouse)0.9851121320925263
Peak sets in benchmark (human)44
Peak sets in benchmark (mouse)119
Aligned words501
TF familyPOU domain factors{3.1.10}
TF subfamilyPOU5 (Oct-3/4-like factors){3.1.10.5}
HGNC9221
EntrezGene5460
UniProt IDPO5F1_HUMAN
UniProt ACQ01860
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.11471
0.0005 11.283760000000001
0.0001 15.82891
GTEx tissue expression atlas POU5F1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list POU5F1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
015.031.029.015.017.057.07.041.00.069.036.038.010.076.027.038.0
020.024.01.07.014.0128.06.085.05.050.010.034.012.075.019.026.0
0314.01.02.014.0124.012.02.0139.018.01.03.014.047.03.04.098.0
043.03.06.0191.02.01.00.014.01.01.03.06.06.05.010.0244.0
055.00.00.07.02.01.01.06.02.01.02.014.021.02.014.0418.0
063.07.015.05.00.01.02.01.09.05.01.02.039.0111.0277.018.0
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0830.015.020.081.01.00.00.03.02.00.03.03.027.0121.029.0161.0
0958.00.00.02.0129.01.00.06.050.00.02.00.0236.01.07.04.0
102.01.00.0470.00.00.00.02.01.00.00.08.00.00.00.012.0
110.00.03.00.00.00.00.01.00.00.00.00.01.00.0453.038.0
120.01.00.00.00.00.00.00.06.0332.048.070.02.031.01.05.0
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14216.016.0103.047.04.00.00.00.03.012.05.08.065.02.012.03.0
15254.04.020.010.026.02.00.02.095.07.012.06.021.011.016.010.0
1662.038.049.0247.011.03.01.09.017.015.07.09.01.06.04.017.0
1725.014.022.030.023.020.07.012.017.018.012.014.049.030.0111.092.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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02-4.393-0.252-3.119-1.447-0.781.409-1.5921.001-1.7620.473-1.1060.091-0.930.876-0.482-0.174
03-0.78-3.119-2.576-0.781.377-0.93-2.5761.491-0.535-3.119-2.226-0.780.412-2.226-1.9681.142
04-2.226-2.226-1.5921.808-2.576-3.119-4.393-0.78-3.119-3.119-2.226-1.592-1.592-1.762-1.1062.052
05-1.762-4.393-4.393-1.447-2.576-3.119-3.119-1.592-2.576-3.119-2.576-0.78-0.384-2.576-0.782.59
06-2.226-1.447-0.713-1.762-4.393-3.119-2.576-3.119-1.207-1.762-3.119-2.5760.2271.2672.179-0.535
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090.621-4.393-4.393-2.5761.416-3.119-4.393-1.5920.473-4.393-2.576-4.3932.019-3.119-1.447-1.968
10-2.576-3.119-4.3932.707-4.393-4.393-4.393-2.576-3.119-4.393-4.393-1.32-4.393-4.393-4.393-0.93
11-4.393-4.393-2.226-4.393-4.393-4.393-4.393-3.119-4.393-4.393-4.393-4.393-3.119-4.3932.670.201
12-4.393-3.119-4.393-4.393-4.393-4.393-4.393-4.393-1.5922.360.4330.808-2.5760.0-3.119-1.762
13-1.968-3.119-4.393-2.2262.204-2.226-0.2940.550.175-4.393-2.576-1.1060.603-4.393-2.226-0.713
141.931-0.651.1920.412-1.968-4.393-4.393-4.393-2.226-0.93-1.762-1.320.734-2.576-0.93-2.226
152.092-1.968-0.431-1.106-0.174-2.576-4.393-2.5761.112-1.447-0.93-1.592-0.384-1.014-0.65-1.106
160.6870.2010.4532.065-1.014-2.226-3.119-1.207-0.591-0.713-1.447-1.207-3.119-1.592-1.968-0.591
17-0.212-0.78-0.338-0.032-0.294-0.431-1.447-0.93-0.591-0.535-0.93-0.780.453-0.0321.2671.08