Model info
Transcription factorPgr
ModelPRGR_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length16
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnRGnACRnRvWGTnCh
Best auROC (human)0.9643171340913753
Best auROC (mouse)0.984634150998403
Peak sets in benchmark (human)51
Peak sets in benchmark (mouse)15
Aligned words405
TF familySteroid hormone receptors (NR3){2.1.1}
TF subfamilyGR-like receptors (NR3C){2.1.1.1}
MGI97567
EntrezGene
UniProt IDPRGR_MOUSE
UniProt ACQ00175
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.620560000000001
0.0005 11.309460000000001
0.0001 14.93441
GTEx tissue expression atlas Pgr expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0149.02.077.08.076.01.09.015.038.02.047.04.031.01.035.010.0
0219.07.0157.011.01.00.03.02.011.03.0137.017.01.02.029.05.0
0310.02.013.07.03.04.00.05.0124.047.0108.047.08.013.02.012.0
04127.03.08.07.059.02.00.05.097.08.05.013.053.05.05.08.0
053.0306.017.010.02.012.02.02.00.016.01.01.00.029.01.03.0
064.00.00.01.0296.011.020.036.08.00.013.00.05.01.09.01.0
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0837.00.031.00.058.01.09.00.0117.01.078.01.032.00.040.00.0
0988.072.061.023.01.00.01.00.054.052.034.018.01.00.00.00.0
1023.031.08.082.033.010.01.080.028.010.01.057.04.04.01.032.0
110.04.084.00.019.04.031.01.00.02.08.01.08.03.0240.00.0
123.02.05.017.03.02.00.08.030.013.016.0304.00.00.00.02.0
1311.015.03.07.05.06.02.04.06.08.03.04.066.0101.058.0106.0
147.068.01.012.015.095.01.019.08.051.03.04.04.0108.02.07.0
156.014.010.04.050.0113.06.0153.00.02.04.01.01.014.08.019.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.653-2.3811.103-1.1211.09-2.927-1.008-0.5130.401-2.3810.612-1.770.2-2.9270.32-0.907
02-0.282-1.2481.813-0.815-2.927-4.226-2.03-2.381-0.815-2.031.677-0.391-2.927-2.3810.134-1.564
03-0.907-2.381-0.653-1.248-2.03-1.77-4.226-1.5641.5770.6121.440.612-1.121-0.653-2.381-0.73
041.601-2.03-1.121-1.2480.838-2.381-4.226-1.5641.333-1.121-1.564-0.6530.731-1.564-1.564-1.121
05-2.032.479-0.391-0.907-2.381-0.73-2.381-2.381-4.226-0.45-2.927-2.927-4.2260.134-2.927-2.03
06-1.77-4.226-4.226-2.9272.446-0.815-0.2320.348-1.121-4.226-0.653-4.226-1.564-2.927-1.008-2.927
070.8380.751.8190.501-2.381-1.77-4.226-1.394-1.564-1.77-0.391-0.45-2.381-1.394-0.138-1.121
080.375-4.2260.2-4.2260.821-2.927-1.008-4.2261.519-2.9271.115-2.9270.231-4.2260.452-4.226
091.2361.0360.871-0.094-2.927-4.226-2.927-4.2260.750.7120.291-0.335-2.927-4.226-4.226-4.226
10-0.0940.2-1.1211.1650.262-0.907-2.9271.1410.1-0.907-2.9270.804-1.77-1.77-2.9270.231
11-4.226-1.771.189-4.226-0.282-1.770.2-2.927-4.226-2.381-1.121-2.927-1.121-2.032.236-4.226
12-2.03-2.381-1.564-0.391-2.03-2.381-4.226-1.1210.168-0.653-0.452.472-4.226-4.226-4.226-2.381
13-0.815-0.513-2.03-1.248-1.564-1.394-2.381-1.77-1.394-1.121-2.03-1.770.9491.3730.8211.421
14-1.2480.979-2.927-0.73-0.5131.312-2.927-0.282-1.1210.693-2.03-1.77-1.771.44-2.381-1.248
15-1.394-0.581-0.907-1.770.6731.485-1.3941.787-4.226-2.381-1.77-2.927-2.927-0.581-1.121-0.282