Model info
Transcription factorProp1
ModelPROP1_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnWAATKAvRTTWn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9277272131475409
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words501
TF familyPaired-related HD factors{3.1.3}
TF subfamilyPROP{3.1.3.20}
MGI109330
EntrezGene19127
UniProt IDPROP1_MOUSE
UniProt ACP97458
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.529515
0.0005 12.408535
0.0001 16.23546
GTEx tissue expression atlas Prop1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0116.09.07.091.027.06.00.099.014.03.08.058.024.06.05.0127.0
0278.00.02.01.023.00.01.00.020.00.00.00.0343.01.09.022.0
03460.03.01.00.01.00.00.00.012.00.00.00.021.00.02.00.0
0419.033.034.0408.03.00.00.00.00.00.00.03.00.00.00.00.0
050.05.02.015.06.05.04.018.02.07.02.023.035.043.067.0266.0
0611.00.032.00.046.00.014.00.052.00.023.00.0149.00.0173.00.0
07116.042.082.018.00.00.00.00.0113.043.070.016.00.00.00.00.0
08173.06.032.018.075.00.03.07.0111.08.022.011.019.00.06.09.0
094.00.00.0374.00.01.00.013.01.00.00.062.02.00.03.040.0
100.02.00.05.00.00.00.01.00.01.00.02.025.035.00.0429.0
1119.00.02.04.029.00.01.08.00.00.00.00.0324.018.022.073.0
12122.057.0115.078.05.08.01.04.07.02.07.09.024.014.034.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.658-1.215-1.4541.061-0.144-1.6-4.41.145-0.788-2.234-1.3280.613-0.26-1.6-1.771.393
020.907-4.4-2.584-3.126-0.302-4.4-3.126-4.4-0.439-4.4-4.4-4.42.384-3.126-1.215-0.346
032.678-2.234-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-0.938-4.4-4.4-4.4-0.392-4.4-2.584-4.4
04-0.490.0540.0832.558-2.234-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4-4.4
05-4.4-1.77-2.584-0.721-1.6-1.77-1.975-0.543-2.584-1.454-2.584-0.3020.1120.3160.7562.131
06-1.022-4.40.023-4.40.383-4.4-0.788-4.40.504-4.4-0.302-4.41.552-4.41.701-4.4
071.3030.2930.957-0.543-4.4-4.4-4.4-4.41.2760.3160.8-0.658-4.4-4.4-4.4-4.4
081.701-1.60.023-0.5430.868-4.4-2.234-1.4541.259-1.328-0.346-1.022-0.49-4.4-1.6-1.215
09-1.975-4.4-4.42.471-4.4-3.126-4.4-0.86-3.126-4.4-4.40.679-2.584-4.4-2.2340.244
10-4.4-2.584-4.4-1.77-4.4-4.4-4.4-3.126-4.4-3.126-4.4-2.584-0.220.112-4.42.608
11-0.49-4.4-2.584-1.975-0.074-4.4-3.126-1.328-4.4-4.4-4.4-4.42.328-0.543-0.3460.841
121.3530.5951.2940.907-1.77-1.328-3.126-1.975-1.454-2.584-1.454-1.215-0.26-0.7880.083-0.86