Model info
Transcription factorRfx3
ModelRFX3_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusbSbGTTGCCWWGGnRACv
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9942581877700319
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words354
TF familyRFX-related factors{3.3.3}
TF subfamilyRFX3{3.3.3.0.3}
MGI106582
EntrezGene19726
UniProt IDRFX3_MOUSE
UniProt ACP48381
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 0.71016
0.0005 3.39241
0.0001 9.155460000000001
GTEx tissue expression atlas Rfx3 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.030.09.05.05.047.023.025.07.092.026.015.00.035.012.017.0
021.05.07.01.013.047.094.050.03.031.032.04.00.012.039.011.0
030.00.017.00.00.00.095.00.00.00.0171.01.00.00.066.00.0
040.00.00.00.00.00.00.00.00.012.00.0337.00.00.00.01.0
050.00.00.00.01.00.00.011.00.00.00.00.03.022.00.0313.0
060.00.04.00.00.00.021.01.00.00.00.00.020.04.0287.013.0
070.020.00.00.00.04.00.00.00.0276.01.035.00.014.00.00.0
080.00.00.00.00.0259.01.054.00.01.00.00.00.033.00.02.0
090.00.00.00.0224.013.017.039.00.00.01.00.049.01.04.02.0
1038.07.030.0198.00.01.04.09.02.00.05.015.09.00.07.025.0
110.00.049.00.00.00.08.00.00.00.046.00.018.00.0229.00.0
120.00.018.00.00.00.00.00.026.03.0303.00.00.00.00.00.0
130.021.05.00.02.01.00.00.086.0118.056.061.00.00.00.00.0
1435.03.050.00.079.03.055.03.040.02.018.01.017.04.033.07.0
15136.012.022.01.09.01.02.00.0139.016.00.01.07.01.01.02.0
161.0262.03.025.02.015.05.08.02.018.02.03.00.03.00.01.0
171.02.02.00.059.095.0111.033.02.03.04.01.06.04.023.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.2410.311-0.865-1.422-1.4220.7560.0490.131-1.1051.4240.17-0.37-4.1070.464-0.587-0.247
02-2.79-1.422-1.105-2.79-0.5090.7561.4450.817-1.8880.3440.375-1.628-4.107-0.5870.571-0.671
03-4.107-4.107-0.247-4.107-4.107-4.1071.456-4.107-4.107-4.1072.042-2.79-4.107-4.1071.093-4.107
04-4.107-4.107-4.107-4.107-4.107-4.107-4.107-4.107-4.107-0.587-4.1072.719-4.107-4.107-4.107-2.79
05-4.107-4.107-4.107-4.107-2.79-4.107-4.107-0.671-4.107-4.107-4.107-4.107-1.8880.006-4.1072.645
06-4.107-4.107-1.628-4.107-4.107-4.107-0.04-2.79-4.107-4.107-4.107-4.107-0.088-1.6282.559-0.509
07-4.107-0.088-4.107-4.107-4.107-1.628-4.107-4.107-4.1072.52-2.790.464-4.107-0.437-4.107-4.107
08-4.107-4.107-4.107-4.107-4.1072.456-2.790.894-4.107-2.79-4.107-4.107-4.1070.406-4.107-2.241
09-4.107-4.107-4.107-4.1072.311-0.509-0.2470.571-4.107-4.107-2.79-4.1070.797-2.79-1.628-2.241
100.545-1.1050.3112.188-4.107-2.79-1.628-0.865-2.241-4.107-1.422-0.37-0.865-4.107-1.1050.131
11-4.107-4.1070.797-4.107-4.107-4.107-0.978-4.107-4.107-4.1070.735-4.107-0.191-4.1072.333-4.107
12-4.107-4.107-0.191-4.107-4.107-4.107-4.107-4.1070.17-1.8882.613-4.107-4.107-4.107-4.107-4.107
13-4.107-0.04-1.422-4.107-2.241-2.79-4.107-4.1071.3571.6720.931.015-4.107-4.107-4.107-4.107
140.464-1.8880.817-4.1071.272-1.8880.912-1.8880.596-2.241-0.191-2.79-0.247-1.6280.406-1.105
151.813-0.5870.006-2.79-0.865-2.79-2.241-4.1071.835-0.307-4.107-2.79-1.105-2.79-2.79-2.241
16-2.792.468-1.8880.131-2.241-0.37-1.422-0.978-2.241-0.191-2.241-1.888-4.107-1.888-4.107-2.79
17-2.79-2.241-2.241-4.1070.9821.4561.6110.406-2.241-1.888-1.628-2.79-1.251-1.6280.049-1.628