Model info
Transcription factorStat5a
ModelSTA5A_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndnTTCYMRGAAn
Best auROC (human)0.9269282089669717
Best auROC (mouse)0.992570270812356
Peak sets in benchmark (human)24
Peak sets in benchmark (mouse)127
Aligned words500
TF familySTAT factors{6.2.1}
TF subfamilySTAT5A{6.2.1.0.5}
MGI103036
EntrezGene20850
UniProt IDSTA5A_MOUSE
UniProt ACP42230
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.643915
0.0005 11.84977
0.0001 15.427790000000002
GTEx tissue expression atlas Stat5a expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0132.011.024.017.094.031.018.041.050.023.033.031.029.022.032.012.0
0249.022.061.073.014.023.09.041.022.027.018.040.016.030.011.044.0
031.03.00.097.00.03.05.094.01.012.02.084.00.04.01.0193.0
041.01.00.00.01.04.00.017.00.00.01.07.024.06.07.0431.0
051.022.02.01.00.011.00.00.01.07.00.00.06.0447.00.02.0
061.05.00.02.012.0213.020.0242.01.00.01.00.00.01.00.02.0
075.09.00.00.0137.079.03.00.010.011.00.00.0101.0145.00.00.0
0892.08.0151.02.0156.013.044.031.01.00.00.02.00.00.00.00.0
091.04.0244.00.00.00.019.02.03.03.0186.03.00.01.033.01.0
103.00.01.00.04.01.01.02.0430.021.09.022.03.01.02.00.0
11415.03.018.04.07.01.09.06.08.03.01.01.020.00.01.03.0
12173.099.097.081.01.02.03.01.04.05.014.06.02.03.07.02.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.023-1.022-0.26-0.5991.093-0.008-0.5430.2690.465-0.3020.054-0.008-0.074-0.3460.023-0.938
020.445-0.3460.6630.841-0.788-0.302-1.2150.269-0.346-0.144-0.5430.244-0.658-0.04-1.0220.339
03-3.126-2.234-4.41.124-4.4-2.234-1.771.093-3.126-0.938-2.5840.981-4.4-1.975-3.1261.81
04-3.126-3.126-4.4-4.4-3.126-1.975-4.4-0.599-4.4-4.4-3.126-1.454-0.26-1.6-1.4542.613
05-3.126-0.346-2.584-3.126-4.4-1.022-4.4-4.4-3.126-1.454-4.4-4.4-1.62.649-4.4-2.584
06-3.126-1.77-4.4-2.584-0.9381.909-0.4392.036-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-3.126-4.4-2.584
07-1.77-1.215-4.4-4.41.4680.92-2.234-4.4-1.114-1.022-4.4-4.41.1651.525-4.4-4.4
081.072-1.3281.565-2.5841.598-0.860.339-0.008-3.126-4.4-4.4-2.584-4.4-4.4-4.4-4.4
09-3.126-1.9752.044-4.4-4.4-4.4-0.49-2.584-2.234-2.2341.773-2.234-4.4-3.1260.054-3.126
10-2.234-4.4-3.126-4.4-1.975-3.126-3.126-2.5842.61-0.392-1.215-0.346-2.234-3.126-2.584-4.4
112.575-2.234-0.543-1.975-1.454-3.126-1.215-1.6-1.328-2.234-3.126-3.126-0.439-4.4-3.126-2.234
121.7011.1451.1240.945-3.126-2.584-2.234-3.126-1.975-1.77-0.788-1.6-2.584-2.234-1.454-2.584