Model info
Transcription factorNR5A1
ModelSTF1_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnbbYCAAGGYCRn
Best auROC (human)0.7754812517235324
Best auROC (mouse)0.9076677848258111
Peak sets in benchmark (human)1
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words500
TF familyFTZ-F1-related receptors (NR5){2.1.5}
TF subfamilyFTZ-F1 (SF-1) (NR5A1){2.1.5.0.1}
HGNC7983
EntrezGene2516
UniProt IDSTF1_HUMAN
UniProt ACQ13285
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.822510000000001
0.0005 10.333635
0.0001 14.46541
GTEx tissue expression atlas NR5A1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list NR5A1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0130.021.0101.018.031.024.026.023.013.017.056.018.09.033.050.030.0
024.026.031.022.016.034.08.037.09.064.079.081.04.033.019.033.0
032.019.01.011.03.078.01.075.011.071.01.054.07.056.01.0109.0
040.023.00.00.00.0218.03.03.00.04.00.00.01.0239.08.01.0
051.00.00.00.0465.04.09.06.09.00.01.01.03.01.00.00.0
06457.00.019.02.04.00.01.00.08.02.00.00.04.00.02.01.0
073.01.0469.00.00.01.01.00.01.00.021.00.00.00.03.00.0
080.01.03.00.00.01.01.00.03.02.0488.01.00.00.00.00.0
092.00.00.01.02.02.00.00.061.0197.07.0227.00.01.00.00.0
104.056.01.04.01.0184.02.013.00.07.00.00.02.0211.04.011.0
114.02.01.00.0375.09.059.015.05.00.01.01.09.05.011.03.0
1259.0129.0125.080.05.05.01.05.014.025.024.09.01.04.09.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.04-0.3921.165-0.543-0.008-0.26-0.181-0.302-0.86-0.5990.578-0.543-1.2150.0540.465-0.04
02-1.975-0.181-0.008-0.346-0.6580.083-1.3280.167-1.2150.7110.920.945-1.9750.054-0.490.054
03-2.584-0.49-3.126-1.022-2.2340.907-3.1260.868-1.0220.814-3.1260.542-1.4540.578-3.1261.241
04-4.4-0.302-4.4-4.4-4.41.932-2.234-2.234-4.4-1.975-4.4-4.4-3.1262.024-1.328-3.126
05-3.126-4.4-4.4-4.42.689-1.975-1.215-1.6-1.215-4.4-3.126-3.126-2.234-3.126-4.4-4.4
062.671-4.4-0.49-2.584-1.975-4.4-3.126-4.4-1.328-2.584-4.4-4.4-1.975-4.4-2.584-3.126
07-2.234-3.1262.697-4.4-4.4-3.126-3.126-4.4-3.126-4.4-0.392-4.4-4.4-4.4-2.234-4.4
08-4.4-3.126-2.234-4.4-4.4-3.126-3.126-4.4-2.234-2.5842.737-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4
09-2.584-4.4-4.4-3.126-2.584-2.584-4.4-4.40.6631.831-1.4541.972-4.4-3.126-4.4-4.4
10-1.9750.578-3.126-1.975-3.1261.763-2.584-0.86-4.4-1.454-4.4-4.4-2.5841.899-1.975-1.022
11-1.975-2.584-3.126-4.42.474-1.2150.63-0.721-1.77-4.4-3.126-3.126-1.215-1.77-1.022-2.234
120.631.4081.3770.932-1.77-1.77-3.126-1.77-0.788-0.22-0.26-1.215-3.126-1.975-1.215-1.77