Model info
Transcription factorRbpj
ModelSUH_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length10
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbbSTGRGAAh
Best auROC (human)0.9522493792921802
Best auROC (mouse)0.9581848488278764
Peak sets in benchmark (human)25
Peak sets in benchmark (mouse)6
Aligned words510
TF familyCSL-related factors{6.1.4}
TF subfamilyM{6.1.4.1}
MGI96522
EntrezGene19664
UniProt IDSUH_MOUSE
UniProt ACP31266
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.576080000000001
0.0005 12.669985
0.0001 15.833549999999999
GTEx tissue expression atlas Rbpj expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
015.031.013.017.05.082.09.055.08.087.017.069.03.046.028.025.0
029.05.07.00.054.077.0106.09.010.021.036.00.013.025.0124.04.0
033.00.02.081.02.01.03.0122.00.01.00.0272.01.00.01.011.0
040.01.04.01.00.02.00.00.00.01.05.00.04.02.0480.00.0
050.00.02.02.00.00.06.00.0166.01.0266.056.00.00.01.00.0
060.01.0164.01.00.00.01.00.00.00.0272.03.00.00.058.00.0
070.00.00.00.00.00.01.00.0486.01.07.01.03.01.00.00.0
08434.015.039.01.01.00.01.00.06.01.01.00.01.00.00.00.0
09152.0148.063.079.04.06.03.03.013.019.03.06.01.00.00.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.77-0.008-0.86-0.599-1.770.957-1.2150.56-1.3281.016-0.5990.785-2.2340.383-0.108-0.22
02-1.215-1.77-1.454-4.40.5420.8941.213-1.215-1.114-0.3920.14-4.4-0.86-0.221.369-1.975
03-2.234-4.4-2.5840.945-2.584-3.126-2.2341.353-4.4-3.126-4.42.153-3.126-4.4-3.126-1.022
04-4.4-3.126-1.975-3.126-4.4-2.584-4.4-4.4-4.4-3.126-1.77-4.4-1.975-2.5842.72-4.4
05-4.4-4.4-2.584-2.584-4.4-4.4-1.6-4.41.66-3.1262.1310.578-4.4-4.4-3.126-4.4
06-4.4-3.1261.648-3.126-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.42.153-2.234-4.4-4.40.613-4.4
07-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-3.126-4.42.733-3.126-1.454-3.126-2.234-3.126-4.4-4.4
082.62-0.7210.219-3.126-3.126-4.4-3.126-4.4-1.6-3.126-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4
091.5721.5450.6950.92-1.975-1.6-2.234-2.234-0.86-0.49-2.234-1.6-3.126-4.4-4.4-4.4