Model info
Transcription factorTfe3
ModelTFE3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndGTCACGTGRbn
Best auROC (human)0.4709917846559691
Best auROC (mouse)0.9999265051994464
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)30
Aligned words525
TF familybHLH-ZIP factors{1.2.6}
TF subfamilyTFE3-like factors{1.2.6.1}
MGI98511
EntrezGene209446
UniProt IDTFE3_MOUSE
UniProt ACQ64092
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.47991
0.0005 6.761710000000001
0.0001 11.636295
GTEx tissue expression atlas Tfe3 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0148.03.055.022.034.02.037.017.059.010.060.049.014.04.070.016.0
0225.01.0128.01.06.00.012.01.026.02.0190.04.06.00.097.01.0
031.00.03.059.00.00.00.03.01.00.09.0417.01.00.03.03.0
040.03.00.00.00.00.00.00.00.015.00.00.02.0478.02.00.0
051.00.01.00.0482.06.04.04.02.00.00.00.00.00.00.00.0
061.0463.03.018.01.04.01.00.00.05.00.00.01.03.00.00.0
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084.01.00.076.01.01.00.00.018.02.02.0389.00.01.02.03.0
091.00.022.00.02.00.03.00.00.00.04.00.00.04.0464.00.0
101.00.01.01.04.00.00.00.0358.034.078.023.00.00.00.00.0
118.0164.041.0150.03.08.05.018.05.019.019.036.02.07.05.010.0
121.06.08.03.056.039.033.070.012.026.018.014.041.080.054.039.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.425-2.2340.56-0.3460.083-2.5840.167-0.5990.63-1.1140.6460.445-0.788-1.9750.8-0.658
02-0.22-3.1261.401-3.126-1.6-4.4-0.938-3.126-0.181-2.5841.795-1.975-1.6-4.41.124-3.126
03-3.126-4.4-2.2340.63-4.4-4.4-4.4-2.234-3.126-4.4-1.2152.58-3.126-4.4-2.234-2.234
04-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-0.721-4.4-4.4-2.5842.716-2.584-4.4
05-3.126-4.4-3.126-4.42.724-1.6-1.975-1.975-2.584-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4
06-3.1262.684-2.234-0.543-3.126-1.975-3.126-4.4-4.4-1.77-4.4-4.4-3.126-2.234-4.4-4.4
07-4.4-4.4-2.234-4.40.907-2.5842.51-1.6-3.126-4.4-2.234-4.4-2.584-4.4-0.658-4.4
08-1.975-3.126-4.40.881-3.126-3.126-4.4-4.4-0.543-2.584-2.5842.51-4.4-3.126-2.584-2.234
09-3.126-4.4-0.346-4.4-2.584-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4-1.975-4.4-4.4-1.9752.686-4.4
10-3.126-4.4-3.126-3.126-1.975-4.4-4.4-4.42.4270.0830.907-0.302-4.4-4.4-4.4-4.4
11-1.3281.6480.2691.559-2.234-1.328-1.77-0.543-1.77-0.49-0.490.14-2.584-1.454-1.77-1.114
12-3.126-1.6-1.328-2.2340.5780.2190.0540.8-0.938-0.181-0.543-0.7880.2690.9320.5420.219