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Model info
Transcription factorTHAP11
(GeneCards)
ModelTHA11_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusSCdnKGSMTbCTGGGAvdTGTAGTY
Best auROC (human)0.95
Best auROC (mouse)0.74
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words107
TF familyTHAP-related factors {2.9.1}
TF subfamilyTHAP11 (HRIHFB2206) {2.9.1.0.11}
HGNCHGNC:23194
EntrezGeneGeneID:57215
(SSTAR profile)
UniProt IDTHA11_HUMAN
UniProt ACQ96EK4
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.13909
0.0005 -2.35639
0.0001 3.76286
GTEx tissue expression atlas THAP11 expression
ReMap ChIP-seq dataset list THAP11 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.08.00.00.01.024.04.03.00.057.00.03.00.05.00.02.0
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190.00.01.00.00.00.012.00.00.00.02.00.00.00.092.00.0
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240.00.00.00.00.00.00.01.00.00.01.00.05.042.02.056.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-3.1740.172-3.174-3.174-1.6871.247-0.486-0.751-3.1742.105-3.174-0.751-3.174-0.277-3.174-1.114
02-1.687-3.174-3.174-3.1741.702-0.2771.7780.388-1.114-1.114-3.174-3.174-1.687-1.687-0.104-3.174
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09-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.2770.172-0.277-3.174-3.174-1.687-1.687-0.7510.9071.6491.5
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12-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.1740.784-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.1742.56-1.687
13-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.1742.714-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174
14-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.277-3.1742.665-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174
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22-3.174-3.1742.695-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.486-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174
23-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-1.6872.714-3.174-3.174-3.174-3.174
24-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-1.687-3.174-0.2771.802-1.1142.088