Model info
Transcription factorTwist1
ModelTWST1_MOUSE.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnvCAKMTGKWWbbvATYWn
Best auROC (human)0.971130114768943
Best auROC (mouse)0.657022384867032
Peak sets in benchmark (human)9
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words415
TF familyTal-related factors{1.2.3}
TF subfamilyTwist-like factors{1.2.3.2}
MGI98872
EntrezGene22160
UniProt IDTWST1_MOUSE
UniProt ACP26687
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.401160000000001
0.0005 9.70411
0.0001 14.56831
GTEx tissue expression atlas Twist1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0154.038.026.03.084.027.09.05.040.027.020.09.021.027.017.06.0
0211.0179.09.00.04.0113.01.01.05.060.03.04.02.018.00.03.0
0319.01.02.00.0359.02.05.04.05.03.03.02.00.00.03.05.0
043.021.092.0267.01.00.00.05.00.01.02.010.00.03.01.07.0
050.04.00.00.011.011.02.01.028.062.05.00.047.0211.030.01.0
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094.00.00.02.010.00.01.032.091.023.023.0113.06.04.06.098.0
1067.06.09.029.08.01.00.018.016.03.02.09.035.019.05.0186.0
1130.027.029.040.01.017.01.010.02.05.01.08.04.085.017.0136.0
125.06.04.022.09.044.05.076.01.017.04.026.09.060.031.094.0
1310.05.06.03.072.033.06.016.015.011.09.09.075.053.065.025.0
14149.014.05.04.096.01.01.04.065.05.07.09.042.00.010.01.0
153.02.09.0338.00.00.00.020.01.00.01.021.00.01.02.015.0
160.01.01.02.01.02.00.00.06.02.02.02.022.055.07.0310.0
1716.00.02.011.042.03.01.014.05.02.01.02.0229.09.010.066.0
1891.045.092.064.04.04.01.05.08.03.00.03.023.018.030.022.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.7310.3820.007-2.0491.170.044-1.027-1.5830.4330.044-0.251-1.027-0.2030.044-0.41-1.413
02-0.8341.924-1.027-4.242-1.7891.465-2.946-2.946-1.5830.835-2.049-1.789-2.4-0.354-4.242-2.049
03-0.301-2.946-2.4-4.2422.619-2.4-1.583-1.789-1.583-2.049-2.049-2.4-4.242-4.242-2.049-1.583
04-2.049-0.2031.2612.323-2.946-4.242-4.242-1.583-4.242-2.946-2.4-0.926-4.242-2.049-2.946-1.267
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07-4.242-2.946-2.4-4.242-4.242-4.242-4.242-2.4-4.242-4.242-4.242-4.242-4.242-4.2422.739-2.049
08-4.242-4.242-4.242-4.242-4.242-2.946-4.242-4.242-1.4130.4812.2421.465-4.242-4.242-1.789-2.946
09-1.789-4.242-4.242-2.4-0.926-4.242-2.9460.2121.25-0.114-0.1141.465-1.413-1.789-1.4131.323
100.945-1.413-1.0270.115-1.14-2.946-4.242-0.354-0.469-2.049-2.4-1.0270.301-0.301-1.5831.962
110.1480.0440.1150.433-2.946-0.41-2.946-0.926-2.4-1.583-2.946-1.14-1.7891.182-0.411.65
12-1.583-1.413-1.789-0.157-1.0270.527-1.5831.07-2.946-0.41-1.7890.007-1.0270.8350.1811.282
13-0.926-1.583-1.413-2.0491.0170.243-1.413-0.469-0.533-0.834-1.027-1.0271.0570.7120.915-0.032
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15-2.049-2.4-1.0272.559-4.242-4.242-4.242-0.251-2.946-4.242-2.946-0.203-4.242-2.946-2.4-0.533
16-4.242-2.946-2.946-2.4-2.946-2.4-4.242-4.242-1.413-2.4-2.4-2.4-0.1570.749-1.2672.472
17-0.469-4.242-2.4-0.8340.481-2.049-2.946-0.6-1.583-2.4-2.946-2.42.17-1.027-0.9260.93
181.250.551.2610.899-1.789-1.789-2.946-1.583-1.14-2.049-4.242-2.049-0.114-0.3540.148-0.157