Model info
Transcription factorZFP42
ModelZFP42_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbRvhKCCATTYbdbd
Best auROC (human)0.938489378124547
Best auROC (mouse)0.8396799203523108
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words343
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyYY1-like factors{2.3.3.9}
HGNC30949
EntrezGene132625
UniProt IDZFP42_HUMAN
UniProt ACQ96MM3
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.7709600000000005
0.0005 9.219910000000002
0.0001 14.161760000000001
GTEx tissue expression atlas ZFP42 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZFP42 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.01.033.01.02.014.026.05.012.05.083.06.05.00.097.03.0
024.013.08.00.013.05.02.00.0117.086.026.010.05.08.00.02.0
037.06.01.0125.069.028.010.05.020.014.01.01.03.06.02.01.0
040.00.097.02.00.00.035.019.00.00.014.00.01.00.02.0129.0
050.01.00.00.00.00.00.00.012.0134.01.01.02.0148.00.00.0
060.014.00.00.00.0283.00.00.00.01.00.00.00.01.00.00.0
070.00.00.00.0296.02.00.01.00.00.00.00.00.00.00.00.0
080.00.00.0296.00.00.00.02.00.00.00.00.00.00.00.01.0
090.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.09.028.021.0241.0
102.01.02.04.02.02.00.024.04.09.01.07.08.0111.06.0116.0
110.08.01.07.04.055.057.07.00.01.02.06.02.016.015.0118.0
121.01.01.03.055.07.06.012.073.01.01.00.026.013.067.032.0
138.012.030.0105.03.06.03.010.014.08.029.024.06.05.022.014.0
1413.06.07.05.08.011.04.08.023.012.028.021.09.09.029.0106.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.097-2.6420.561-2.642-2.09-0.2830.325-1.268-0.433-1.2681.476-1.097-1.268-3.9791.632-1.736
02-1.475-0.355-0.824-3.979-0.355-1.268-2.09-3.9791.8181.5120.325-0.609-1.268-0.824-3.979-2.09
03-0.951-1.097-2.6421.8841.2930.398-0.609-1.2680.067-0.283-2.642-2.642-1.736-1.097-2.09-2.642
04-3.979-3.9791.632-2.09-3.979-3.9790.6190.016-3.979-3.979-0.283-3.979-2.642-3.979-2.091.916
05-3.979-2.642-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-0.4331.954-2.642-2.642-2.092.053-3.979-3.979
06-3.979-0.283-3.979-3.979-3.9792.7-3.979-3.979-3.979-2.642-3.979-3.979-3.979-2.642-3.979-3.979
07-3.979-3.979-3.979-3.9792.745-2.09-3.979-2.642-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979
08-3.979-3.979-3.9792.745-3.979-3.979-3.979-2.09-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-2.642
09-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-3.979-0.7110.3980.1152.54
10-2.09-2.642-2.09-1.475-2.09-2.09-3.9790.246-1.475-0.711-2.642-0.951-0.8241.766-1.0971.81
11-3.979-0.824-2.642-0.951-1.4751.0671.103-0.951-3.979-2.642-2.09-1.097-2.09-0.152-0.2151.827
12-2.642-2.642-2.642-1.7361.067-0.951-1.097-0.4331.349-2.642-2.642-3.9790.325-0.3551.2630.53
13-0.824-0.4330.4661.711-1.736-1.097-1.736-0.609-0.283-0.8240.4330.246-1.097-1.2680.16-0.283
14-0.355-1.097-0.951-1.268-0.824-0.517-1.475-0.8240.204-0.4330.3980.115-0.711-0.7110.4331.72