Check the newest release v12
Model info
Transcription factorZkscan1
ModelZKSC1_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndvhdbhCCTACTRWGTGYhn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.969
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)6
Aligned words476
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF24-like factors {2.3.3.10}
MGIMGI:1921820
EntrezGeneGeneID:74570
(SSTAR profile)
UniProt IDZKSC1_MOUSE
UniProt ACQ8BGS3
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.91571
0.0005 6.26596
0.0001 11.32761
GTEx tissue expression atlas Zkscan1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0135.011.019.038.035.014.06.087.026.011.016.032.029.017.027.050.0
0255.015.045.010.018.012.011.012.014.08.030.016.022.017.0159.09.0
0369.08.015.017.020.014.02.016.0103.060.013.069.011.06.014.016.0
0446.015.0130.012.035.08.014.031.020.04.015.05.035.010.063.010.0
0520.025.073.018.07.012.08.010.016.078.074.054.011.05.039.03.0
0615.011.017.011.082.015.08.015.069.058.026.041.033.018.024.010.0
072.0195.01.01.00.0100.01.01.02.072.00.01.01.074.01.01.0
080.04.01.00.025.0389.03.024.00.03.00.00.00.04.00.00.0
090.020.00.05.00.041.01.0358.00.02.00.02.00.04.019.01.0
100.00.00.00.062.00.03.02.020.00.00.00.0355.03.06.02.0
114.0420.010.03.00.02.00.01.02.04.03.00.00.02.02.00.0
120.00.00.06.04.01.00.0423.02.06.00.07.01.00.00.03.0
131.01.04.01.06.00.01.00.00.00.00.00.0173.06.0257.03.0
1444.09.08.0119.02.01.02.02.05.013.026.0218.00.00.02.02.0
152.04.044.01.00.02.020.01.01.04.031.02.00.03.0337.01.0
162.01.00.00.01.02.00.010.06.057.021.0348.00.03.02.00.0
170.03.06.00.011.08.028.016.02.06.013.02.015.010.0322.011.0
184.018.04.02.05.011.04.07.031.0272.019.047.03.016.05.05.0
1910.016.08.09.081.0109.09.0118.07.015.05.05.05.027.015.014.0
2024.024.041.014.085.027.09.046.07.016.08.06.040.035.042.029.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.209-0.925-0.3920.2910.209-0.691-1.5031.114-0.084-0.925-0.5610.1210.024-0.501-0.0470.563
020.658-0.6240.458-1.017-0.445-0.84-0.925-0.84-0.691-1.2310.057-0.561-0.248-0.5011.715-1.118
030.883-1.231-0.624-0.501-0.342-0.691-2.489-0.5611.2820.744-0.7630.883-0.925-1.503-0.691-0.561
040.48-0.6241.514-0.840.209-1.231-0.6910.09-0.342-1.879-0.624-1.6740.209-1.0170.792-1.017
05-0.342-0.1230.939-0.445-1.358-0.84-1.231-1.017-0.5611.0050.9530.639-0.925-1.6740.317-2.138
06-0.624-0.925-0.501-0.9251.055-0.624-1.231-0.6240.8830.71-0.0840.3660.151-0.445-0.163-1.017
07-2.4891.918-3.033-3.033-4.3181.252-3.033-3.033-2.4890.925-4.318-3.033-3.0330.953-3.033-3.033
08-4.318-1.879-3.033-4.318-0.1232.608-2.138-0.163-4.318-2.138-4.318-4.318-4.318-1.879-4.318-4.318
09-4.318-0.342-4.318-1.674-4.3180.366-3.0332.525-4.318-2.489-4.318-2.489-4.318-1.879-0.392-3.033
10-4.318-4.318-4.318-4.3180.777-4.318-2.138-2.489-0.342-4.318-4.318-4.3182.516-2.138-1.503-2.489
11-1.8792.684-1.017-2.138-4.318-2.489-4.318-3.033-2.489-1.879-2.138-4.318-4.318-2.489-2.489-4.318
12-4.318-4.318-4.318-1.503-1.879-3.033-4.3182.692-2.489-1.503-4.318-1.358-3.033-4.318-4.318-2.138
13-3.033-3.033-1.879-3.033-1.503-4.318-3.033-4.318-4.318-4.318-4.318-4.3181.799-1.5032.194-2.138
140.436-1.118-1.2311.426-2.489-3.033-2.489-2.489-1.674-0.763-0.0842.03-4.318-4.318-2.489-2.489
15-2.489-1.8790.436-3.033-4.318-2.489-0.342-3.033-3.033-1.8790.09-2.489-4.318-2.1382.465-3.033
16-2.489-3.033-4.318-4.318-3.033-2.489-4.318-1.017-1.5030.693-0.2942.497-4.318-2.138-2.489-4.318
17-4.318-2.138-1.503-4.318-0.925-1.231-0.011-0.561-2.489-1.503-0.763-2.489-0.624-1.0172.419-0.925
18-1.879-0.445-1.879-2.489-1.674-0.925-1.879-1.3580.092.25-0.3920.502-2.138-0.561-1.674-1.674
19-1.017-0.561-1.231-1.1181.0421.338-1.1181.417-1.358-0.624-1.674-1.674-1.674-0.047-0.624-0.691
20-0.163-0.1630.366-0.6911.09-0.047-1.1180.48-1.358-0.561-1.231-1.5030.3420.2090.390.024