Model info
Transcription factorZkscan1
ModelZKSC1_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndvhdbhCCTACTRWGTGYhn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9694776539365626
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)6
Aligned words476
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF24-like factors{2.3.3.10}
MGI1921820
EntrezGene74570
UniProt IDZKSC1_MOUSE
UniProt ACQ8BGS3
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.91571
0.0005 6.26596
0.0001 11.32761
GTEx tissue expression atlas Zkscan1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0135.011.019.038.035.014.06.087.026.011.016.032.029.017.027.050.0
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0369.08.015.017.020.014.02.016.0103.060.013.069.011.06.014.016.0
0446.015.0130.012.035.08.014.031.020.04.015.05.035.010.063.010.0
0520.025.073.018.07.012.08.010.016.078.074.054.011.05.039.03.0
0615.011.017.011.082.015.08.015.069.058.026.041.033.018.024.010.0
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090.020.00.05.00.041.01.0358.00.02.00.02.00.04.019.01.0
100.00.00.00.062.00.03.02.020.00.00.00.0355.03.06.02.0
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120.00.00.06.04.01.00.0423.02.06.00.07.01.00.00.03.0
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162.01.00.00.01.02.00.010.06.057.021.0348.00.03.02.00.0
170.03.06.00.011.08.028.016.02.06.013.02.015.010.0322.011.0
184.018.04.02.05.011.04.07.031.0272.019.047.03.016.05.05.0
1910.016.08.09.081.0109.09.0118.07.015.05.05.05.027.015.014.0
2024.024.041.014.085.027.09.046.07.016.08.06.040.035.042.029.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.209-0.925-0.3920.2910.209-0.691-1.5031.114-0.084-0.925-0.5610.1210.024-0.501-0.0470.563
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09-4.318-0.342-4.318-1.674-4.3180.366-3.0332.525-4.318-2.489-4.318-2.489-4.318-1.879-0.392-3.033
10-4.318-4.318-4.318-4.3180.777-4.318-2.138-2.489-0.342-4.318-4.318-4.3182.516-2.138-1.503-2.489
11-1.8792.684-1.017-2.138-4.318-2.489-4.318-3.033-2.489-1.879-2.138-4.318-4.318-2.489-2.489-4.318
12-4.318-4.318-4.318-1.503-1.879-3.033-4.3182.692-2.489-1.503-4.318-1.358-3.033-4.318-4.318-2.138
13-3.033-3.033-1.879-3.033-1.503-4.318-3.033-4.318-4.318-4.318-4.318-4.3181.799-1.5032.194-2.138
140.436-1.118-1.2311.426-2.489-3.033-2.489-2.489-1.674-0.763-0.0842.03-4.318-4.318-2.489-2.489
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20-0.163-0.1630.366-0.6911.09-0.047-1.1180.48-1.358-0.561-1.231-1.5030.3420.2090.390.024