Model info
Transcription factorZNF136
ModelZN136_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusTGCTGGRTAYAGWATTCTWGGYTGRCA
Best auROC (human)0.9723908485648464
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words100
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF763-like factors{2.3.3.33}
HGNC12920
EntrezGene7695
UniProt IDZN136_HUMAN
UniProt ACP52737
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.84684
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0.0001 3.33126
GTEx tissue expression atlas ZNF136 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF136 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.00.01.01.06.01.00.02.00.00.03.00.03.02.076.04.0
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267.00.00.00.080.00.01.00.00.00.00.00.010.00.01.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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04-3.123-3.123-1.625-3.123-0.422-3.123-3.123-0.687-3.123-3.123-3.123-3.1230.546-1.6252.495-1.625
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10-1.05-3.123-3.123-3.1231.533-3.123-3.123-1.625-1.625-3.123-3.123-3.1232.27-3.123-0.687-3.123
110.709-0.4222.495-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-0.687-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-1.625-3.123
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15-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-1.05-3.123-3.123-3.123-0.422-1.625-0.422-1.6252.603
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24-3.123-3.123-0.687-3.123-1.625-3.123-3.123-3.1232.222-1.051.5-1.625-3.123-3.123-0.422-3.123
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