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Model info
Transcription factorZNF140
(GeneCards)
ModelZN140_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYRAYYCAGCAATTCCACTCCYRRRYRY
Best auROC (human)0.98
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words249
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF302-like factors {2.3.3.44}
HGNCHGNC:12925
EntrezGeneGeneID:7699
(SSTAR profile)
UniProt IDZN140_HUMAN
UniProt ACP52738
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -13.81139
0.0005 -10.50309
0.0001 -3.17674
GTEx tissue expression atlas ZNF140 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF140 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.05.03.08.021.04.08.02.07.00.014.02.022.06.0142.03.0
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268.018.012.0131.06.03.00.010.01.04.03.030.05.07.02.09.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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11-3.831-3.831-3.8312.74-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-1.559-3.831-3.831-3.831-3.831
12-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.8312.752
13-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.8312.752-3.831-3.831
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