Model info
Transcription factorZNF140
ModelZN140_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYRAYYCAGCAATTCCACTCCYRRRYRY
Best auROC (human)0.9804833517669898
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words249
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF302-like factors{2.3.3.44}
HGNC12925
EntrezGene7699
UniProt IDZN140_HUMAN
UniProt ACP52738
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -13.81139
0.0005 -10.50309
0.0001 -3.17674
GTEx tissue expression atlas ZNF140 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF140 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.05.03.08.021.04.08.02.07.00.014.02.022.06.0142.03.0
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120.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0249.0
130.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0249.00.00.0
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180.00.00.00.00.03.00.00.00.00.00.00.00.0246.00.00.0
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236.02.026.06.01.07.04.07.026.016.0118.017.03.01.05.04.0
242.03.03.028.04.09.01.012.014.020.010.0109.06.05.06.017.0
2515.02.02.07.025.05.00.07.07.05.06.02.0122.07.030.07.0
268.018.012.0131.06.03.00.010.01.04.03.030.05.07.02.09.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-1.0912.126-0.2541.229-1.915-0.773-3.831-0.773-1.915-0.176-1.915-1.559-1.915-0.919-3.831-2.471
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09-3.831-3.831-3.831-3.8312.744-3.831-2.471-2.471-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831
102.732-3.831-1.559-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-2.471-3.831-3.831-3.831-2.471-3.831-3.831-3.831
11-3.831-3.831-3.8312.74-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-1.559-3.831-3.831-3.831-3.831
12-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.8312.752
13-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.8312.752-3.831-3.831
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16-3.8312.205-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.8311.89-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831
17-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-1.559-3.8312.74-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831
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19-3.831-3.831-3.831-3.8310.1432.596-3.8310.143-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831-3.831
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