Check the newest release v12
Model info
Transcription factorZNF143
(GeneCards)
ModelZN143_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSYvvdGSMYbMTGGGARdTGTAGTY
Best auROC (human)0.993
Best auROC (mouse)0.987
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words386
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors {2.3.3.28}
HGNCHGNC:12928
EntrezGeneGeneID:7702
(SSTAR profile)
UniProt IDZN143_HUMAN
UniProt ACP52747
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -6.1740900000000005
0.0005 -3.19034
0.0001 3.33251
GTEx tissue expression atlas ZNF143 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF143 datasets
Motifs in JASPAR
MA0088.1 (znf143; Xenopus laevis)
MA0088.2 (ZNF143; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.013.03.00.013.063.010.018.013.0211.05.012.00.012.05.02.0
029.03.012.02.0109.014.0150.026.05.010.08.00.010.05.017.00.0
0345.019.053.016.010.01.015.06.040.042.080.025.08.07.08.05.0
0420.07.065.011.015.01.032.021.048.06.068.034.010.00.018.024.0
053.00.089.01.00.01.012.01.07.04.0158.014.01.00.084.05.0
061.07.03.00.00.02.03.00.021.0226.080.016.00.012.06.03.0
0713.05.01.03.0123.095.011.018.038.044.02.08.07.08.03.01.0
081.035.017.0128.00.032.03.0117.00.06.01.010.01.05.02.022.0
090.02.00.00.06.011.028.033.01.02.018.02.08.060.0104.0105.0
102.012.00.01.021.043.03.08.011.0124.05.010.06.0100.027.07.0
111.016.00.023.02.029.02.0246.00.06.00.029.00.012.00.014.0
120.00.03.00.00.00.063.00.00.00.02.00.02.00.0309.01.0
130.00.02.00.00.00.00.00.01.00.0376.00.00.00.01.00.0
140.00.01.00.00.00.00.00.02.01.0371.05.00.00.00.00.0
152.00.00.00.01.00.00.00.0342.05.018.07.03.02.00.00.0
16166.026.0135.021.04.02.01.00.06.02.010.00.05.00.02.00.0
17104.09.029.039.03.02.01.024.029.012.010.097.02.01.01.017.0
181.08.06.0123.01.02.02.019.01.09.01.030.03.014.015.0145.0
190.00.06.00.01.00.032.00.00.00.024.00.05.00.0311.01.0
200.01.04.01.00.00.00.00.016.020.014.0323.00.00.00.01.0
2113.00.02.01.016.02.02.01.016.01.01.00.0310.00.014.01.0
221.01.0353.00.01.00.02.00.00.00.019.00.00.01.02.00.0
230.00.01.01.01.00.01.00.00.02.04.0370.00.00.00.00.0
241.00.00.00.01.00.00.01.01.03.01.01.010.0186.09.0166.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-4.174-0.59-1.968-4.174-0.590.966-0.844-0.272-0.592.171-1.502-0.668-4.174-0.668-1.502-2.32
02-0.945-1.968-0.668-2.321.512-0.5181.830.089-1.502-0.844-1.058-4.174-0.844-1.502-0.328-4.174
030.632-0.2190.794-0.388-0.844-2.867-0.451-1.3310.5150.5631.2040.051-1.058-1.186-1.058-1.502
04-0.169-1.1860.997-0.752-0.451-2.8670.294-0.1210.696-1.3311.0420.354-0.844-4.174-0.2720.01
05-1.968-4.1741.31-2.867-4.174-2.867-0.668-2.867-1.186-1.7081.882-0.518-2.867-4.1741.252-1.502
06-2.867-1.186-1.968-4.174-4.174-2.32-1.968-4.174-0.1212.2391.204-0.388-4.174-0.668-1.331-1.968
07-0.59-1.502-2.867-1.9681.6321.375-0.752-0.2720.4640.609-2.32-1.058-1.186-1.058-1.968-2.867
08-2.8670.383-0.3281.672-4.1740.294-1.9681.582-4.174-1.331-2.867-0.844-2.867-1.502-2.32-0.075
09-4.174-2.32-4.174-4.174-1.331-0.7520.1620.325-2.867-2.32-0.272-2.32-1.0580.9171.4651.474
10-2.32-0.668-4.174-2.867-0.1210.587-1.968-1.058-0.7521.64-1.502-0.844-1.3311.4260.126-1.186
11-2.867-0.388-4.174-0.032-2.320.197-2.322.324-4.174-1.331-4.1740.197-4.174-0.668-4.174-0.518
12-4.174-4.174-1.968-4.174-4.174-4.1740.966-4.174-4.174-4.174-2.32-4.174-2.32-4.1742.551-2.867
13-4.174-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.867-4.1742.747-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174
14-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.32-2.8672.734-1.502-4.174-4.174-4.174-4.174
15-2.32-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.1742.653-1.502-0.272-1.186-1.968-2.32-4.174-4.174
161.9310.0891.725-0.121-1.708-2.32-2.867-4.174-1.331-2.32-0.844-4.174-1.502-4.174-2.32-4.174
171.465-0.9450.1970.49-1.968-2.32-2.8670.010.197-0.668-0.8441.395-2.32-2.867-2.867-0.328
18-2.867-1.058-1.3311.632-2.867-2.32-2.32-0.219-2.867-0.945-2.8670.23-1.968-0.518-0.4511.796
19-4.174-4.174-1.331-4.174-2.867-4.1740.294-4.174-4.174-4.1740.01-4.174-1.502-4.1742.558-2.867
20-4.174-2.867-1.708-2.867-4.174-4.174-4.174-4.174-0.388-0.169-0.5182.596-4.174-4.174-4.174-2.867
21-0.59-4.174-2.32-2.867-0.388-2.32-2.32-2.867-0.388-2.867-2.867-4.1742.555-4.174-0.518-2.867
22-2.867-2.8672.684-4.174-2.867-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-0.219-4.174-4.174-2.867-2.32-4.174
23-4.174-4.174-2.867-2.867-2.867-4.174-2.867-4.174-4.174-2.32-1.7082.731-4.174-4.174-4.174-4.174
24-2.867-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-2.867-2.867-1.968-2.867-2.867-0.8442.045-0.9451.931