Model info
Transcription factorZNF143
ModelZN143_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSYvvdGSMYbMTGGGARdTGTAGTY
Best auROC (human)0.9934485537250237
Best auROC (mouse)0.9865660381226524
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words386
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors{2.3.3.28}
HGNC12928
EntrezGene7702
UniProt IDZN143_HUMAN
UniProt ACP52747
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -6.1740900000000005
0.0005 -3.19034
0.0001 3.33251
GTEx tissue expression atlas ZNF143 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF143 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.013.03.00.013.063.010.018.013.0211.05.012.00.012.05.02.0
029.03.012.02.0109.014.0150.026.05.010.08.00.010.05.017.00.0
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0420.07.065.011.015.01.032.021.048.06.068.034.010.00.018.024.0
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102.012.00.01.021.043.03.08.011.0124.05.010.06.0100.027.07.0
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140.00.01.00.00.00.00.00.02.01.0371.05.00.00.00.00.0
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181.08.06.0123.01.02.02.019.01.09.01.030.03.014.015.0145.0
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2113.00.02.01.016.02.02.01.016.01.01.00.0310.00.014.01.0
221.01.0353.00.01.00.02.00.00.00.019.00.00.01.02.00.0
230.00.01.01.01.00.01.00.00.02.04.0370.00.00.00.00.0
241.00.00.00.01.00.00.01.01.03.01.01.010.0186.09.0166.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-4.174-0.59-1.968-4.174-0.590.966-0.844-0.272-0.592.171-1.502-0.668-4.174-0.668-1.502-2.32
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04-0.169-1.1860.997-0.752-0.451-2.8670.294-0.1210.696-1.3311.0420.354-0.844-4.174-0.2720.01
05-1.968-4.1741.31-2.867-4.174-2.867-0.668-2.867-1.186-1.7081.882-0.518-2.867-4.1741.252-1.502
06-2.867-1.186-1.968-4.174-4.174-2.32-1.968-4.174-0.1212.2391.204-0.388-4.174-0.668-1.331-1.968
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10-2.32-0.668-4.174-2.867-0.1210.587-1.968-1.058-0.7521.64-1.502-0.844-1.3311.4260.126-1.186
11-2.867-0.388-4.174-0.032-2.320.197-2.322.324-4.174-1.331-4.1740.197-4.174-0.668-4.174-0.518
12-4.174-4.174-1.968-4.174-4.174-4.1740.966-4.174-4.174-4.174-2.32-4.174-2.32-4.1742.551-2.867
13-4.174-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.867-4.1742.747-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174
14-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.32-2.8672.734-1.502-4.174-4.174-4.174-4.174
15-2.32-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.1742.653-1.502-0.272-1.186-1.968-2.32-4.174-4.174
161.9310.0891.725-0.121-1.708-2.32-2.867-4.174-1.331-2.32-0.844-4.174-1.502-4.174-2.32-4.174
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21-0.59-4.174-2.32-2.867-0.388-2.32-2.32-2.867-0.388-2.867-2.867-4.1742.555-4.174-0.518-2.867
22-2.867-2.8672.684-4.174-2.867-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-0.219-4.174-4.174-2.867-2.32-4.174
23-4.174-4.174-2.867-2.867-2.867-4.174-2.867-4.174-4.174-2.32-1.7082.731-4.174-4.174-4.174-4.174
24-2.867-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-2.867-2.867-1.968-2.867-2.867-0.8442.045-0.9451.931