Model info
Transcription factorZnf143
ModelZN143_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSCRvdGSMYbMTGGGAvdYGTAGTY
Best auROC (human)0.9985137275093403
Best auROC (mouse)0.9921367204494507
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words465
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors{2.3.3.28}
MGI1277969
EntrezGene20841
UniProt IDZN143_MOUSE
UniProt ACO70230
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.4793400000000005
0.0005 -2.5558899999999998
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GTEx tissue expression atlas Znf143 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.017.02.01.07.082.04.016.018.0270.08.018.01.014.01.04.0
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220.03.0402.02.03.05.03.02.04.03.030.02.00.01.03.00.0
231.00.05.01.01.03.04.04.01.05.011.0421.02.01.01.02.0
243.00.00.02.01.01.02.05.03.09.06.03.07.0194.018.0209.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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12-4.336-4.336-1.9-4.336-4.336-4.3361.169-4.336-4.336-4.336-2.159-4.336-2.51-4.3362.509-4.336
13-4.336-4.336-2.51-4.336-4.336-4.336-4.336-4.336-3.054-4.3362.752-3.054-4.336-4.336-4.336-4.336
14-4.336-4.336-3.054-4.336-4.336-4.336-4.336-4.336-1.9-3.0542.741-2.51-4.336-4.336-3.054-4.336
15-1.9-4.336-4.336-4.336-3.054-4.336-4.336-4.3362.641-1.379-0.712-0.184-4.336-2.51-4.336-4.336
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24-2.159-4.336-4.336-2.51-3.054-3.054-2.51-1.695-2.159-1.139-1.525-2.159-1.3791.892-0.4671.966