Model info
Transcription factorZNF329
ModelZN329_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusSCTKGATCMARCYdYdCCTGAAR
Best auROC (human)0.8571633069806781
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words305
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyunclassified{2.3.3.0}
HGNC14209
EntrezGene79673
UniProt IDZN329_HUMAN
UniProt ACQ86UD4
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.82859
0.0005 -2.81114
0.0001 3.7903599999999997
GTEx tissue expression atlas ZNF329 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF329 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
012.09.01.00.01.0234.00.01.01.037.00.01.00.015.00.00.0
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159.01.07.02.026.00.07.010.015.02.08.02.068.07.0108.030.0
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190.00.01.00.00.00.00.00.01.00.02.00.02.00.0296.00.0
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2242.020.0194.015.00.00.00.03.00.01.08.01.01.03.013.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.099-0.72-2.651-3.987-2.6512.5-3.987-2.651-2.6510.664-3.987-2.651-3.987-0.225-3.987-3.987
02-3.987-2.651-3.987-1.746-2.0990.456-3.9872.617-3.987-3.987-2.651-3.987-2.651-3.987-3.987-2.651
03-3.987-3.987-2.099-2.651-1.107-2.099-1.107-0.103-3.987-3.987-2.651-3.9870.006-2.6512.4390.352
04-3.987-3.9870.276-3.987-3.987-3.987-1.746-3.987-1.485-2.6512.452-2.651-3.987-3.9870.858-3.987
05-1.485-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-2.6512.704-2.099-1.485-1.746-2.651-3.987-3.987-3.987
06-1.107-1.746-0.1622.632-3.987-3.987-2.651-2.651-3.987-3.987-2.099-2.099-3.987-3.987-2.099-2.099
07-3.987-1.485-3.987-2.099-3.987-1.746-3.987-3.987-2.6510.006-2.651-3.987-0.9612.566-0.961-0.833
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091.268-0.527-0.619-1.1072.175-1.278-2.651-1.278-1.107-2.651-1.746-3.987-0.527-3.987-1.278-2.651
100.637-1.1072.378-1.278-0.619-2.099-1.278-3.987-1.746-1.278-0.527-3.987-1.746-2.099-1.107-2.651
11-2.6510.963-3.987-2.651-3.987-0.292-3.987-2.651-1.7462.448-3.987-1.485-3.987-1.107-3.987-3.987
12-2.099-2.651-2.651-3.987-0.4422.199-2.0991.701-3.987-3.987-3.987-3.987-2.651-3.987-3.987-1.278
13-1.746-2.099-0.961-1.7461.8-0.162-0.0470.236-2.651-3.987-2.099-3.9870.52-1.4851.253-0.961
14-1.4850.057-0.1621.765-1.746-2.099-2.651-0.162-0.527-0.442-0.8331.192-2.651-0.72-2.0990.151
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19-3.987-3.987-2.651-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-2.651-3.987-2.099-3.987-2.099-3.9872.735-3.987
20-1.746-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-3.987-3.9872.6470.236-2.099-2.099-3.987-3.987-3.987-3.987
212.562-2.651-0.833-0.1620.006-2.651-2.099-2.099-2.099-3.987-3.987-3.987-2.651-2.651-3.987-3.987
220.790.0572.313-0.225-3.987-3.987-3.987-1.746-3.987-2.651-0.833-2.651-2.651-1.746-0.365-2.651