Model info
Transcription factorZnf335
ModelZN335_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndRGvYKbCYnvnRvdvYGCCTGWn
Best auROC (human)0.893748741575936
Best auROC (mouse)0.9865627610717758
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words114
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers{2.3.4}
TF subfamilyunclassified{2.3.4.0}
MGI2682313
EntrezGene329559
UniProt IDZN335_MOUSE
UniProt ACA2A5K6
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.14866
0.0005 6.26521
0.0001 10.86086
GTEx tissue expression atlas Znf335 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.03.08.05.01.02.011.07.04.06.023.08.04.01.017.08.0
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220.00.02.00.00.00.02.00.01.00.06.01.02.02.091.07.0
233.00.00.00.01.00.01.00.061.012.05.023.05.01.00.02.0
2418.020.013.019.03.02.01.07.00.06.00.00.08.09.04.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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