Model info
Transcription factorZNF394
ModelZN394_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusdvvMMdRvARbhdvWdRSMAdvh
Best auROC (human)0.9117125496101645
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words390
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyunclassified{2.3.3.0}
HGNC18832
EntrezGene84124
UniProt IDZN394_HUMAN
UniProt ACQ53GI3
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.97321
0.0005 12.68941
0.0001 16.28741
GTEx tissue expression atlas ZNF394 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF394 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0143.07.020.05.057.06.02.08.033.015.09.019.033.074.038.09.0
0256.052.048.010.045.07.049.01.018.014.030.07.025.02.011.03.0
0396.025.022.01.059.09.03.04.092.020.021.05.014.01.06.00.0
04224.020.08.09.045.02.01.07.030.012.08.02.02.05.01.02.0
0595.013.045.0148.017.03.01.018.07.00.04.07.08.00.02.010.0
0622.09.085.011.04.05.04.03.012.05.026.09.026.05.0147.05.0
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1019.021.032.0102.07.07.04.048.019.019.022.073.01.01.00.03.0
1125.05.04.012.019.013.04.012.033.07.04.014.060.074.026.066.0
1236.08.076.017.019.06.061.013.02.011.024.01.018.018.027.041.0
1337.018.010.010.025.011.05.02.0129.032.017.010.022.033.014.03.0
14173.021.012.07.031.07.01.055.020.05.03.018.017.00.03.05.0
1564.010.053.0114.09.04.04.016.07.03.04.05.019.01.053.012.0
1637.01.057.04.06.03.04.05.058.02.045.09.020.00.0123.04.0
1716.015.090.00.03.00.01.02.017.032.0174.06.00.04.015.03.0
1819.011.04.02.026.013.01.011.0195.046.013.026.07.02.02.00.0
19215.014.016.02.057.07.04.04.06.09.02.03.028.05.01.05.0
2082.026.037.0161.08.08.02.017.011.03.03.06.06.02.01.05.0
2153.024.018.012.08.026.01.04.012.022.05.04.020.0108.049.012.0
2234.019.09.031.0114.029.04.033.026.024.010.013.017.07.03.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.592-1.18-0.164-1.4970.872-1.326-2.315-1.0530.33-0.445-0.94-0.2140.331.1310.469-0.94
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051.38-0.5850.6371.822-0.323-1.963-2.862-0.267-1.18-4.17-1.703-1.18-1.053-4.17-2.315-0.839
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120.416-1.0531.158-0.323-0.214-1.3260.939-0.585-2.315-0.7470.016-2.862-0.267-0.2670.1320.545
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210.7990.016-0.267-0.663-1.0530.094-2.862-1.703-0.663-0.07-1.497-1.703-0.1641.5080.721-0.663
220.359-0.214-0.940.2681.5620.202-1.7030.330.0940.016-0.839-0.585-0.323-1.18-1.963-1.497