Model info
Transcription factorZNF436
ModelZN436_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusRKCMdGGARGRCTTCCTGGAGGAGGhG
Best auROC (human)0.983795717183079
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words485
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF180-like factors{2.3.3.58}
HGNC20814
EntrezGene80818
UniProt IDZN436_HUMAN
UniProt ACQ9C0F3
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -12.96254
0.0005 -9.53949
0.0001 -2.08659
GTEx tissue expression atlas ZNF436 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF436 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0116.025.035.0215.02.03.00.07.07.06.020.0120.02.04.02.021.0
022.09.01.015.00.033.00.05.05.033.05.014.03.0339.012.09.0
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110.081.00.00.00.029.00.00.00.0367.00.00.00.08.00.00.0
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181.00.024.00.00.00.00.00.015.07.0414.011.00.00.012.01.0
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211.00.055.01.00.00.00.00.04.01.0423.00.00.00.00.00.0
225.00.00.00.00.00.00.01.0435.017.06.020.01.00.00.00.0
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242.00.074.00.00.00.00.00.011.01.0391.06.00.00.00.00.0
250.01.07.05.00.00.00.01.078.0104.022.0261.02.01.01.02.0
2611.04.065.00.061.08.035.02.06.02.022.00.011.04.0251.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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10-3.097-2.554-0.628-4.375-3.097-4.375-2.554-4.3750.95-0.1512.429-1.298-4.375-3.097-3.097-4.375
11-4.3750.975-4.375-4.375-4.375-0.044-4.375-4.375-4.3752.482-4.375-4.375-4.375-1.298-4.375-4.375
12-4.375-4.375-4.375-4.375-1.084-0.908-1.742.703-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375
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21-3.097-4.3750.59-3.097-4.375-4.375-4.375-4.375-1.946-3.0972.624-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375
22-1.74-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-3.0972.652-0.569-1.57-0.409-3.097-4.375-4.375-4.375
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