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Model info
Transcription factorZNF490
(GeneCards)
ModelZN490_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusGTYTCTTGWAGRCAGCAKAYMRWTGGR
Best auROC (human)0.996
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words421
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF763-like factors {2.3.3.33}
HGNCHGNC:23705
EntrezGeneGeneID:57474
(SSTAR profile)
UniProt IDZN490_HUMAN
UniProt ACQ9ULM2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -17.986089999999997
0.0005 -14.312539999999998
0.0001 -6.25784
GTEx tissue expression atlas ZNF490 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF490 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.01.01.020.00.00.00.03.01.04.06.0380.00.00.02.02.0
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232.02.02.083.00.01.00.030.00.01.01.021.03.05.06.0263.0
241.00.04.00.02.00.07.00.01.00.07.01.028.01.0361.07.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-4.256-2.962-2.962-0.268-4.256-4.256-4.256-2.065-2.962-1.805-1.4292.659-4.256-4.256-2.416-2.416
02-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-2.065-4.256-2.416-4.256-1.429-4.256-2.065-1.4292.257-2.4161.684
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04-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.416-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.4162.742-2.065-4.256
05-4.256-4.256-4.256-2.416-1.805-0.616-4.2562.703-4.256-4.256-4.256-2.065-4.256-4.256-4.256-4.256
06-4.256-4.256-2.962-2.065-4.256-4.256-4.256-0.616-4.256-4.256-4.256-4.256-2.416-2.962-1.4292.693
07-4.256-4.256-2.416-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-1.284-4.256-2.416-2.4162.723-2.962
08-2.962-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-2.4162.072-1.284-1.4291.972-4.256-4.256-4.256-2.962
092.038-2.962-1.805-2.065-1.284-4.256-4.256-4.256-1.429-4.256-4.256-4.2561.978-2.962-4.256-2.416
100.441-1.8052.571-0.486-4.256-4.256-2.962-2.962-4.256-4.256-2.065-2.962-2.962-4.256-1.805-4.256
11-0.549-4.2560.028-4.256-1.805-4.256-4.256-4.2561.919-4.2561.862-1.805-0.549-4.256-2.065-4.256
12-4.2562.09-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.2562.023-4.256-4.256-4.256-1.805-4.256-4.256
13-4.256-4.256-4.256-4.2562.757-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
141.265-4.2562.503-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
15-4.2561.276-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.4162.494-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
16-2.416-4.256-4.256-4.2562.752-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
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20-1.805-1.044-2.962-2.9620.8981.366-1.805-0.268-2.962-4.256-4.256-4.2561.3271.347-2.065-1.429
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24-2.962-4.256-1.805-4.256-2.416-4.256-1.284-4.256-2.962-4.256-1.284-2.9620.064-2.9622.608-1.284
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