Model info
Transcription factorZNF490
ModelZN490_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusGTYTCTTGWAGRCAGCAKAYMRWTGGR
Best auROC (human)0.9955872247977802
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words421
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZNF763-like factors{2.3.3.33}
HGNC23705
EntrezGene57474
UniProt IDZN490_HUMAN
UniProt ACQ9ULM2
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -17.986089999999997
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0.0001 -6.25784
GTEx tissue expression atlas ZNF490 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF490 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.01.01.020.00.00.00.03.01.04.06.0380.00.00.02.02.0
020.00.00.01.00.03.00.02.00.06.00.03.06.0254.02.0143.0
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1820.00.01.00.028.00.03.00.0113.01.03.00.0247.00.04.00.0
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2263.027.017.0134.00.00.01.027.021.03.05.099.05.01.00.017.0
232.02.02.083.00.01.00.030.00.01.01.021.03.05.06.0263.0
241.00.04.00.02.00.07.00.01.00.07.01.028.01.0361.07.0
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268.01.041.01.01.00.00.02.043.02.0273.043.00.00.05.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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02-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-2.065-4.256-2.416-4.256-1.429-4.256-2.065-1.4292.257-2.4161.684
03-4.256-4.256-4.256-1.429-4.256-2.962-4.2562.288-4.256-4.256-4.256-2.416-4.256-2.962-4.2561.718
04-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.416-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.4162.742-2.065-4.256
05-4.256-4.256-4.256-2.416-1.805-0.616-4.2562.703-4.256-4.256-4.256-2.065-4.256-4.256-4.256-4.256
06-4.256-4.256-2.962-2.065-4.256-4.256-4.256-0.616-4.256-4.256-4.256-4.256-2.416-2.962-1.4292.693
07-4.256-4.256-2.416-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-1.284-4.256-2.416-2.4162.723-2.962
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092.038-2.962-1.805-2.065-1.284-4.256-4.256-4.256-1.429-4.256-4.256-4.2561.978-2.962-4.256-2.416
100.441-1.8052.571-0.486-4.256-4.256-2.962-2.962-4.256-4.256-2.065-2.962-2.962-4.256-1.805-4.256
11-0.549-4.2560.028-4.256-1.805-4.256-4.256-4.2561.919-4.2561.862-1.805-0.549-4.256-2.065-4.256
12-4.2562.09-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.2562.023-4.256-4.256-4.256-1.805-4.256-4.256
13-4.256-4.256-4.256-4.2562.757-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
141.265-4.2562.503-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
15-4.2561.276-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-2.4162.494-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
16-2.416-4.256-4.256-4.2562.752-4.256-4.256-4.256-2.962-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256-4.256
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18-0.268-4.256-2.962-4.2560.064-4.256-2.065-4.2561.449-2.962-2.065-4.2562.229-4.256-1.805-4.256
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20-1.805-1.044-2.962-2.9620.8981.366-1.805-0.268-2.962-4.256-4.256-4.2561.3271.347-2.065-1.429
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220.8670.028-0.4271.619-4.256-4.256-2.9620.028-0.22-2.065-1.61.317-1.6-2.962-4.256-0.427
23-2.416-2.416-2.4161.141-4.256-2.962-4.2560.132-4.256-2.962-2.962-0.22-2.065-1.6-1.4292.292
24-2.962-4.256-1.805-4.256-2.416-4.256-1.284-4.256-2.962-4.256-1.284-2.9620.064-2.9622.608-1.284
25-1.805-4.2560.064-4.256-2.962-4.256-4.256-4.2560.555-2.4162.506-1.6-4.256-2.962-1.284-4.256
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