Model info
Transcription factorZNF549
ModelZN549_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusdYYAKvRRhhGGRSAGShhhnnd
Best auROC (human)0.9733292451326881
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words317
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyunclassified{2.3.3.0}
HGNC26632
EntrezGene256051
UniProt IDZN549_HUMAN
UniProt ACQ6P9A3
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.919560000000001
0.0005 9.80461
0.0001 13.87971
GTEx tissue expression atlas ZNF549 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF549 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
018.06.04.030.05.04.00.032.03.010.06.035.09.013.019.0130.0
021.015.07.02.03.020.00.010.02.026.00.01.02.0175.07.043.0
038.00.00.00.0221.04.03.08.09.03.01.01.054.00.00.02.0
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0624.05.010.03.029.03.09.07.0119.019.036.012.016.05.012.05.0
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1312.045.014.05.06.014.02.06.03.0182.06.04.00.09.04.02.0
1414.01.01.05.0212.02.013.023.021.01.00.04.010.01.04.02.0
159.09.0237.02.00.00.02.03.00.04.012.02.02.020.09.03.0
164.05.00.02.03.04.014.012.04.0220.024.012.01.00.04.05.0
176.04.00.02.0134.045.015.035.018.06.02.016.014.02.013.02.0
1837.075.027.033.010.020.05.022.02.019.05.04.03.022.013.017.0
198.014.03.027.026.056.02.052.08.016.08.018.08.038.09.021.0
206.09.028.07.055.039.04.026.03.09.06.04.014.049.035.020.0
2130.016.026.06.056.024.01.025.010.027.028.08.08.013.020.016.0
2247.09.044.04.037.017.03.023.050.05.011.09.07.07.027.014.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.872-1.145-1.5230.418-1.316-1.523-4.0180.482-1.783-0.657-1.1450.571-0.759-0.403-0.0321.875
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05-2.137-0.999-0.657-1.783-1.145-2.688-4.018-1.5230.314-0.20.3140.112-0.9990.1982.011-0.759
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13-0.4810.82-0.331-1.316-1.145-0.331-2.137-1.145-1.7832.211-1.145-1.523-4.018-0.759-1.523-2.137
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