Model info
Transcription factorZNF708
ModelZN708_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusvvnvhvddRRdnAGGYACAGCYv
Best auROC (human)0.8561619077264785
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words312
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyunclassified{2.3.3.0}
HGNC12945
EntrezGene7562
UniProt IDZN708_HUMAN
UniProt ACP17019
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.5961099999999995
0.0005 6.06956
0.0001 11.402460000000001
GTEx tissue expression atlas ZNF708 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF708 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0119.03.048.09.019.016.03.013.010.011.0110.08.010.010.019.04.0
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0320.024.021.07.017.088.00.011.022.019.019.012.011.017.018.06.0
0422.012.019.017.019.014.07.0108.016.016.018.08.03.014.010.09.0
0529.011.012.08.019.021.05.011.018.016.011.09.0106.013.015.08.0
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202.04.00.01.00.03.00.00.016.0266.06.012.00.02.00.00.0
219.02.01.06.048.067.03.0157.02.03.01.00.02.06.00.05.0
2217.09.020.015.033.020.04.021.00.04.01.00.015.022.0114.017.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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13-4.013-4.0132.703-2.682-4.013-4.013-4.013-4.013-4.013-4.013-0.651-2.682-4.013-2.682-1.777-4.013
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21-0.752-2.13-2.682-1.1390.891.221-1.7772.07-2.13-1.777-2.682-4.013-2.13-1.139-4.013-1.31
22-0.135-0.7520.025-0.2570.5190.025-1.5160.073-4.013-1.516-2.682-4.013-0.2570.1191.751-0.135