Model info
Transcription factorZNF41
ModelZNF41_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusvRMRRGRRARhvvRvSACMAWSRKbnR
Best auROC (human)0.9193599228514766
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words335
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors{2.3.3}
TF subfamilyZFN81-like factors{2.3.3.68}
HGNC13107
EntrezGene7592
UniProt IDZNF41_HUMAN
UniProt ACP51814
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.397259999999999
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0.0001 12.577560000000002
GTEx tissue expression atlas ZNF41 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF41 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0138.014.024.07.0144.013.02.06.028.05.08.04.018.010.011.03.0
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0312.014.011.04.0198.06.010.014.016.01.09.02.010.05.019.04.0
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1129.021.027.010.045.07.05.012.09.08.06.04.070.023.029.030.0
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1437.017.067.010.07.03.02.02.045.051.049.016.04.06.011.08.0
152.065.015.011.06.062.03.06.04.090.028.07.03.024.03.06.0
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183.01.02.01.059.0231.00.013.013.04.02.01.04.00.00.01.0
1947.02.027.03.0227.05.03.01.01.00.02.01.07.00.08.01.0
2027.08.020.0227.04.01.01.01.09.05.08.018.02.00.01.03.0
215.06.029.02.06.03.01.04.05.05.017.03.020.032.0185.012.0
2225.00.011.00.038.01.02.05.0176.012.017.027.010.00.09.02.0
2321.016.0183.029.05.04.04.00.07.07.018.07.02.05.022.05.0
248.01.019.07.06.06.02.018.036.040.0104.047.00.019.011.011.0
2511.07.028.04.039.06.09.012.040.015.070.011.012.014.042.015.0
2685.04.010.03.017.013.04.08.0109.015.013.012.011.04.022.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.588-0.3940.134-1.0621.914-0.466-2.199-1.2080.286-1.379-0.935-1.586-0.148-0.72-0.628-1.846
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091.893-0.2642.0-1.846-2.199-4.071-4.071-4.071-1.208-4.071-1.846-4.071-2.749-2.199-1.586-4.071
100.7780.734-0.5440.82-0.544-2.199-4.071-1.5860.250.092-0.3941.55-2.199-4.071-2.749-4.071
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